The aim of this work was to identify the interaction partners of the tick-borne encephalitis virus capsid protein within the cytoplasmic, membrane, and especially the nuclear fraction of infected DAOY HTB-186 cells. Firstly, the subcellular fractionation method was optimized. Secondly, the immunoprecipitation method and benzonase digestion were optimized; and finally, interaction partners from each fraction were identified using mass spectrometry.
Klíčová slova
-
Klíčová slova v angličtině
tick-borne encephalitis virus, capsid protein, subcellular fractionation, immunoprecipitation, mass spectrometry
Rozsah průvodní práce
59 s.
Jazyk
AN
Anotace
-
Anotace v angličtině
The aim of this work was to identify the interaction partners of the tick-borne encephalitis virus capsid protein within the cytoplasmic, membrane, and especially the nuclear fraction of infected DAOY HTB-186 cells. Firstly, the subcellular fractionation method was optimized. Secondly, the immunoprecipitation method and benzonase digestion were optimized; and finally, interaction partners from each fraction were identified using mass spectrometry.
Klíčová slova
-
Klíčová slova v angličtině
tick-borne encephalitis virus, capsid protein, subcellular fractionation, immunoprecipitation, mass spectrometry
Zásady pro vypracování
-
Zásady pro vypracování
-
Seznam doporučené literatury
-
Seznam doporučené literatury
-
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Změna složení komise - nebyl přítomen RNDr. Radek Litvín, Ph.D.;
RNDr. Martin Selinger, Ph.D. - online připojení.
1. Představení práce studentkou.
2. Posudek školitele.
3. Posudky oponentů.
4. Odpověďi studentky na dotazy a připomínky oponentů.
5. Diskuze - po zodpovězení dotazů a připomínek oponentů již nebyly položeny žádné další dotazy členy komise.