Práce se zaměřuje na lokalizaci hemové dráhy u řasy Chromera velia, která je nejbližším známým fotosyntetizujícím příbuzným parazitů ze skupiny Apicomplexa. Hemová dráha je jednou z esenciálních biochemických drah většiny žijících organismů. Organismy používají pro syntézu hemu enzymu lišící se svým evolučním původem, který odráží jejich složitou evoluční historii. Základem této práce je kombinace in výpočetních a experimentálních lokalizací enzymů hemové dráhy řasy Chromera velia. Ukázali jsme, že lokalizace hemové dráhy v rámci buňky je řízena vícero faktory zahrnující poptávku po produktech dráhy, potřebu přísné regulace a v neposlední řadě i evolučním původem enzymů.
Anotace v angličtině
This thesis is focused on the localization of the heme pathway in Chromera velia - the closest known photosynthetic relative of apicomplexan parasites. The heme pathway belongs to essential processes in most living organisms. Organisms use enzymes of various evolutionary origins, reflecting their complex evolutionary history. The core of this study represents the combination of computational and experimental localization of the C. velia heme pathway. We showed that the localization of the heme pathway in the cell is driven by multiple factors, including the demand for pathway products, the need for tight regulation of the pathway, and the evolutionary origin of the enzymes
Klíčová slova
Heme pathway, Chromera velia, protein targeting, protein predictions
Klíčová slova v angličtině
Heme pathway, Chromera velia, protein targeting, protein predictions
Rozsah průvodní práce
130
Jazyk
AN
Anotace
Práce se zaměřuje na lokalizaci hemové dráhy u řasy Chromera velia, která je nejbližším známým fotosyntetizujícím příbuzným parazitů ze skupiny Apicomplexa. Hemová dráha je jednou z esenciálních biochemických drah většiny žijících organismů. Organismy používají pro syntézu hemu enzymu lišící se svým evolučním původem, který odráží jejich složitou evoluční historii. Základem této práce je kombinace in výpočetních a experimentálních lokalizací enzymů hemové dráhy řasy Chromera velia. Ukázali jsme, že lokalizace hemové dráhy v rámci buňky je řízena vícero faktory zahrnující poptávku po produktech dráhy, potřebu přísné regulace a v neposlední řadě i evolučním původem enzymů.
Anotace v angličtině
This thesis is focused on the localization of the heme pathway in Chromera velia - the closest known photosynthetic relative of apicomplexan parasites. The heme pathway belongs to essential processes in most living organisms. Organisms use enzymes of various evolutionary origins, reflecting their complex evolutionary history. The core of this study represents the combination of computational and experimental localization of the C. velia heme pathway. We showed that the localization of the heme pathway in the cell is driven by multiple factors, including the demand for pathway products, the need for tight regulation of the pathway, and the evolutionary origin of the enzymes
Klíčová slova
Heme pathway, Chromera velia, protein targeting, protein predictions
Klíčová slova v angličtině
Heme pathway, Chromera velia, protein targeting, protein predictions