Krystalizace proteinů PsbQ a PsbP podle popsaných krystalizačních podmínek.
Fotosyntéza je proces probíhající ve fotosyntetických organizmech, kdy dochází k přeměně světelné energie na energii chemickou. Jedním z produktů reakce je kyslík, který vzniká v membránovém komplexu - fotosystému II. Součástí membránového komplexu fotosystému II je kyslík vyvíjející komplex, který se skládá z proteinů PsbO, PsbQ, PsbP a PsbR. Určení struktury jednotlivých proteinů tvořících kyslík vyvíjející komplex umožní pochopit mechanizmus tvorby kyslíku v procesu fotosyntézy.
Krystalizační podmínky a struktura proteinů PsbP a PsbQ z fotosystému II vyšších rostlin je popsaná. Cílem práce je zvládnutí metodiky použité pro krystalizaci proteinu z fotosystému II vyšších rostlin. Student získá znalosti proteomiky (příprava roztoků, SDS-PAGE analýza, určení koncentrace proteinů, získaní vzorků potřebné koncentrace) a krystalizace (získání krystalů vhodných pro měření jejich difrakce a následné strukturní analýzy). Pro přípravu proteinů budou připravené dvě modifikace rekombinantních proteinů a porovnány jejich krystalizační podmínky a kvalita krystalů.
Zásady pro vypracování
Krystalizace proteinů PsbQ a PsbP podle popsaných krystalizačních podmínek.
Fotosyntéza je proces probíhající ve fotosyntetických organizmech, kdy dochází k přeměně světelné energie na energii chemickou. Jedním z produktů reakce je kyslík, který vzniká v membránovém komplexu - fotosystému II. Součástí membránového komplexu fotosystému II je kyslík vyvíjející komplex, který se skládá z proteinů PsbO, PsbQ, PsbP a PsbR. Určení struktury jednotlivých proteinů tvořících kyslík vyvíjející komplex umožní pochopit mechanizmus tvorby kyslíku v procesu fotosyntézy.
Krystalizační podmínky a struktura proteinů PsbP a PsbQ z fotosystému II vyšších rostlin je popsaná. Cílem práce je zvládnutí metodiky použité pro krystalizaci proteinu z fotosystému II vyšších rostlin. Student získá znalosti proteomiky (příprava roztoků, SDS-PAGE analýza, určení koncentrace proteinů, získaní vzorků potřebné koncentrace) a krystalizace (získání krystalů vhodných pro měření jejich difrakce a následné strukturní analýzy). Pro přípravu proteinů budou připravené dvě modifikace rekombinantních proteinů a porovnány jejich krystalizační podmínky a kvalita krystalů.
Seznam doporučené literatury
1. M. Balsera, J.B. Arellano, J.L. Revuelta, J. De Las Rivas, J.A. Hermoso, The 1.49A resolution crystal structure of PsbQ from photosystem II of Spinacia oleracea reveals a PPII structure in the N-terminal region, J. Mol. Biol. 350 (2005) 1051-1060
2. Kohoutová, J., Kuta Smatanová, I., Brynda, J., Lapkouski, M., Revuelta J. L., Arellano, J. B. \& Ettrich, R.(2009). Crystallization and preliminary crystallographic characterization of the extrinsic PsbP protein of photosystem II from Spinacia oleracea, Acta Cryst. F65, 111-115
3. Fyziologie rostlin - dostupná literatura k dané problematice
Seznam doporučené literatury
1. M. Balsera, J.B. Arellano, J.L. Revuelta, J. De Las Rivas, J.A. Hermoso, The 1.49A resolution crystal structure of PsbQ from photosystem II of Spinacia oleracea reveals a PPII structure in the N-terminal region, J. Mol. Biol. 350 (2005) 1051-1060
2. Kohoutová, J., Kuta Smatanová, I., Brynda, J., Lapkouski, M., Revuelta J. L., Arellano, J. B. \& Ettrich, R.(2009). Crystallization and preliminary crystallographic characterization of the extrinsic PsbP protein of photosystem II from Spinacia oleracea, Acta Cryst. F65, 111-115
3. Fyziologie rostlin - dostupná literatura k dané problematice