Díky novým molekulárním metodám, které byly použity pro revizi mnohých tradičních taxonů sinic, se vyjasňují jejich skutečné systematické pozice. Merismopediaceae je poměrně málo zkoumaná skupina sinic, a proto její mnohé podskupiny nebyly dostatečně molekulárně revidovány. V této práci byly použity standardní molekulární metody polyfázického přístupu jak na environmentální izoláty taxonů náležících čeledi Merismopeidaceae, tak na kmeny v kultuře. Následná fylogenetická analýza založená na genu 16S rRNA odhaluje polyfyletismus rodů Merismopedia a Eucapsis. Tato práce rovněž obsahuje vůbec první molekulární analýzu rodu Microcrocis.
Anotace v angličtině
Thanks to new molecular methods, which have been used for revision of many traditional cyanobacterial taxa, their real systematic positions have become clearer. Merismopediaceae is a relatively understudied group of Cyanobacteria, therefore many subordinate taxa have not been sufficiently molecularly reviewed. In this thesis standard molecular methods of the polyphasic approach were used on environmental isolates as well as cultured strains of Merismopediaceae taxa. Subsequent phylogeny analysis based on 16S rRNA gene shows the polyplyly of genera Merismopedia and Eucapsis. The thesis also includes the very first molecular evidence of the taxonomic position of the genus Microcrocis.
Klíčová slova
Algologie, sinice, single cell sequencing, fylogeneze, tvorba kolonie, mikrokapilární izolace, polyfyletismus, konvergentní evoluce, postavení tylakoidů, transmisní elektronová mikroskopie
Klíčová slova v angličtině
Phycology, cyanobacteria, single cell sequencing, phylogeny, colony formation, microcapilary isolation, polyphyly, convergent evolution, thylakoid architecture, trasmission electron microscopy
Rozsah průvodní práce
81 s. (158 345 znaků)
Jazyk
CZ
Anotace
Díky novým molekulárním metodám, které byly použity pro revizi mnohých tradičních taxonů sinic, se vyjasňují jejich skutečné systematické pozice. Merismopediaceae je poměrně málo zkoumaná skupina sinic, a proto její mnohé podskupiny nebyly dostatečně molekulárně revidovány. V této práci byly použity standardní molekulární metody polyfázického přístupu jak na environmentální izoláty taxonů náležících čeledi Merismopeidaceae, tak na kmeny v kultuře. Následná fylogenetická analýza založená na genu 16S rRNA odhaluje polyfyletismus rodů Merismopedia a Eucapsis. Tato práce rovněž obsahuje vůbec první molekulární analýzu rodu Microcrocis.
Anotace v angličtině
Thanks to new molecular methods, which have been used for revision of many traditional cyanobacterial taxa, their real systematic positions have become clearer. Merismopediaceae is a relatively understudied group of Cyanobacteria, therefore many subordinate taxa have not been sufficiently molecularly reviewed. In this thesis standard molecular methods of the polyphasic approach were used on environmental isolates as well as cultured strains of Merismopediaceae taxa. Subsequent phylogeny analysis based on 16S rRNA gene shows the polyplyly of genera Merismopedia and Eucapsis. The thesis also includes the very first molecular evidence of the taxonomic position of the genus Microcrocis.
Klíčová slova
Algologie, sinice, single cell sequencing, fylogeneze, tvorba kolonie, mikrokapilární izolace, polyfyletismus, konvergentní evoluce, postavení tylakoidů, transmisní elektronová mikroskopie
Klíčová slova v angličtině
Phycology, cyanobacteria, single cell sequencing, phylogeny, colony formation, microcapilary isolation, polyphyly, convergent evolution, thylakoid architecture, trasmission electron microscopy
Zásady pro vypracování
-
Zásady pro vypracování
-
Seznam doporučené literatury
-
Seznam doporučené literatury
-
Přílohy volně vložené
1 alignment (fasta), 1 obrázek (pdf)
Přílohy vázané v práci
schémata, tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Odůvodnění nezveřejnění VŠKP
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Obhajoba proběhla prezenčně; komise zasedla ve jmenovaném složení; přítomno bylo osm hostů.
Student představil svou práci.
Školitel a oponenti přečetli své posudky práce, student zevrubně zodpověděl otázky položené v posudku.
Další otázky z komise a z od přítomných hostů:
Jaké jsou důvody vyšší úspěšnosti sekvenování 16S rDNA? Student okomentoval.
Jak je to s holotypem rodu Merismopedia – žádost o vyjasnění.