Extracellular polymeric substances (EPS) are produced by microorganisms for several reasons. It has long been assumed that EPS are produced only for the purpose of protecting the cell (e.g., capsule, slime layer) and in the formation of biofilms. However, new studies show that EPS are also produced by various microorganisms in response to environmental stress caused by lack of water, nutrients, or extreme temperature. EPS contain mainly polysaccharides and proteins, but also DNA or RNA. They link different groups of microorganisms to form biofilms, facilitate nutrient transfer, allow efficient intercellular communication and defense against predators. However, EPS also link soil particles and organic matter, influencing the formation of soil aggregates and the stability of soil organic matter, which affects the amount of CO2 that can be released into the atmosphere. In the permafrost of the Arctic, from which CO2 is released due to warming from the decomposition of soil organic matter, understanding the influence of EPS-producing microorganisms is essential. The aim of this work was to isolate and identify EPS-producing microorganisms from different areas of degraded permafrost (i.e., dry, and wet scenarios) and evaluate their representation in the overall microbiome.
Klíčová slova
-
Klíčová slova v angličtině
EPS, bacteria, permafrost, medium
Rozsah průvodní práce
27 s. (43 134 znaků bez mezer)
Jazyk
AN
Anotace
-
Anotace v angličtině
Extracellular polymeric substances (EPS) are produced by microorganisms for several reasons. It has long been assumed that EPS are produced only for the purpose of protecting the cell (e.g., capsule, slime layer) and in the formation of biofilms. However, new studies show that EPS are also produced by various microorganisms in response to environmental stress caused by lack of water, nutrients, or extreme temperature. EPS contain mainly polysaccharides and proteins, but also DNA or RNA. They link different groups of microorganisms to form biofilms, facilitate nutrient transfer, allow efficient intercellular communication and defense against predators. However, EPS also link soil particles and organic matter, influencing the formation of soil aggregates and the stability of soil organic matter, which affects the amount of CO2 that can be released into the atmosphere. In the permafrost of the Arctic, from which CO2 is released due to warming from the decomposition of soil organic matter, understanding the influence of EPS-producing microorganisms is essential. The aim of this work was to isolate and identify EPS-producing microorganisms from different areas of degraded permafrost (i.e., dry, and wet scenarios) and evaluate their representation in the overall microbiome.
Klíčová slova
-
Klíčová slova v angličtině
EPS, bacteria, permafrost, medium
Zásady pro vypracování
-
Zásady pro vypracování
-
Seznam doporučené literatury
-
Seznam doporučené literatury
-
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
ilustrace, tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Obhajoba proběhla prezenční formou. Přítomni byli všichni jmenovaní členové komise a školitel; oponent se omluvil.
Zahájení obhajoby v 11:45, ukončení ve 12:30
Předseda komise zahájil obhajobu. Uchazečka přednesla v 15 minutách svoji prezentaci. Následovalo přednesení školitelského a oponentského posudku. Na otázky a komentáře oponenta byla uchazečka dobře připravena. V rozpravě zazněly další otázky:
- (Kaštovská) Jaké zastoupení těchto primárních producentů (zjištěných ve vaší práci) byste očekávala v temperátních půdách? Odkud přesně pocházely odebrané vzorky – byly opravdu z aktivní vrstvy?
- (Boukal) Objevují se ve vašich výsledcích i nějaké druhy, které EPS neprodukují? Produkce EPS je velmi nákladná, známe z literatury i příklady druhů, které EPS neprodukují, ale „svezou se“ s ostatními druhy? V metodice nemáte dobře popsané, co se dělo se vzorky mezi odebráním a vaším výzkumem.
- (Čapek) Potvrdila jste svými výsledky hypotézu v úvodu, že se mění produkce EPS mikroorganismů v „suchém scénáři“? Upozornění, že citované zdroje občas neobsahují tvrzení, na které odkazují. Co přesně znamená energetická náročnost tvorby EPS? Jaká je horizontální struktura v zastoupení EPS producentů v půdě?
- (Choma) Čím je zvláštní médium na detekci EPS oproti normálnímu médiu na pěstování mikroorganismů?
Komise byla s odpověďmi uchazečky spokojena.
Následovala uzavřená rozprava komise zakončená tajným hlasováním. Výsledek hlasování: 2, 2, 2, 2, 2. Výsledná známka: velmi dobře;