Předmět: Biostatistika

« Zpět
Název předmětu Biostatistika
Kód předmětu KBE/012
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V každém akademickém roce, jen v letním semestru.
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 7
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinný, Povinně-volitelný, Volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Šmilauer Petr, doc. RNDr. Ph.D.
  • Koutecký Petr, Mgr. Ph.D.
  • Lisner Aleš, RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Obsah přednášek: Základní pojmy, deduktivní a induktivní uvažování, obecná vědecká metoda, konfirmační analýza dat, jak lze pomocí statistiky lhát a jak na to lze přijít. Základní soubor a výběr, deskriptivní statistiky. Analýza kategoriálních dat, principy testování hypotéz. Analýza spojitých dat klasifikovaných do skupin (t-test, ANOVA). Vztah dvou kvantitativních proměnných, regrese a korelace. Poissonovo rozdělení, binomické rozdělení a jejich užití. Metody mnohorozměrné statistiky a jejich využití. Neparametrické metody jsou probírány vždy s příslušnými metodami parametrickými. Obsah cvičení: Ve cvičeních se prakticky užívají metody probírané na přednáškách s použitím programu R (a RStudio).

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Písemná práce (např. u souborných zkoušek, klauzur), Demonstrace, Projekce (statická, dynamická), Nácvik pohybových a pracovních dovedností
  • Účast na výuce - 56 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 28 hodin za semestr
  • Příprava na zápočet - 40 hodin za semestr
  • Semestrální práce - 16 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 40 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem přednášky je seznámit studenty se základními principy statistického uvažování a s jejich aplikací na data biologických oborů. Celá přednáška je zaměřena na pochopení principů a především na aplikaci statistických metod a na správnou interpretaci výsledků statistických testů. Absolvent kurzu bude připraven zpracovat data pro účely vlastní bakalářské či diplomové práce a správně výsledky testů interpretovat. Dále bude chápat význam statistických hodnocení, které se vyskytují prakticky ve všech odborných článcích současných oborů biologie. Neměl by se nechat zmást tam, kde složitý statistický aparát zastírá chabou podstatu dat. Vše je demonstrováno na biologických příkladech, pokud možno blízkých těm, které bývají v bakalářských a magisterských pracech. Studenti se naučí zpracovat data pomocí statistického programu R.
Absolventi budou schopni: (1) převést výzkumné otázky na testovatelné hypotézy a odpovídající nulové statistické hypotézy, a take navrhnout uspořádání pokusu či pozorování, které povede k získání kvalitních dat (2) identifikovat typy dat, která danému problému odpovídají, a určit typy statistických modelů a metod, která jsou pro dané typy dat vhodná (3) zvolit a aplikovat vhodné typy statistických metod a modelů, zahrnující například test dobré shody, analýzu kontingenčních tabulek, jednovýběrový, párový a dvouvýběrový t-test (plus odpovídající neparametrické testy), analýzu variance (plus odpovídající neparametrické testy) včetně analýzy dat s blokovým uspořádáním, metody jednoduché a mnohonásobné regrese. Dále budou schopni ověřit základní předpoklady těchto metod (4) pomocí výběrových statistik a vhodných grafů shrnout analyzovaná data a hlavní závěry jejich analýzy
Předpoklady
Matematické znalosti v rozsahu středoškolského učiva (lineární algebra, teorie pravděpodobnosti).

Hodnoticí metody a kritéria
Esej, Kombinovaná zkouška, Test, Průběžné hodnocení

Účast na cvičeních je kontrolována (max. 2 nevysvětlené absence). V polovině semestru jsou znalosti ze cvičení ověřovány průběžným testem (0-5 bodů), jehož výsledky se kombinují se závěrečným zápočtovým testem (0-45 bodů). Minimální počet bodů pro zápočet je 27. Před ústní zkouškou musí student dodat esej reprezentující fiktivní odborný článek se zaměřením na analýzu dat. Při ústní zkoušce je esej diskutována a bodována (0-5 bodů), spolu s odpověďmi na dvě otázky náhodně vybrané z obsahu kurzu (u nich se hodnotí znalost teorie, 0-5 bodů každá). Pro úspěšné absolvování zkoušky je minimální počet bodů 8.
Doporučená literatura
  • Lepš J., Šmilauer P. Biostatistika. Episteme, České Budějovice, 2016. ISBN 978-80-7394-587-9.
  • Sokal R.R., Rohlf F.J. Biometry. 4th edition. Freeman, San Francisco, 2012.
  • Zar J.H. Biostatistical analysis, 5th edition. Pearson, San Francisco, 2010.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie (1) Kategorie: Biologické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie ekosystémů - specializace Půdní biologie (1) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie ekosystémů - specializace Hydrobiologie (1) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Archeologie (2016) Kategorie: Obory z oblasti historie 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biomedicínská laboratorní technika (1) Kategorie: Biologické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Péče o životní prostředí (1) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie ekosystémů - specializace Aplikovaná ekologie (1) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Aplikovaná matematika (2010) Kategorie: Matematické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Chemie (1) Kategorie: Chemické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Matematika pro vzdělávání (1) Kategorie: Matematické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Experimentální biologie - specializace Molekulární a buněčná biologie a genetika (1) Kategorie: Biologické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Archeologie (2016) Kategorie: Obory z oblasti historie 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Matematika pro vzdělávání (1) Kategorie: Matematické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Experimentální biologie - specializace Fyziologie rostlin (1) Kategorie: Biologické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie ekosystémů - specializace Biologie ochrany přírody (1) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie ekosystémů - specializace Ekologie (1) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní