Předmět: Analýza genomu zvířat

« Zpět
Název předmětu Analýza genomu zvířat
Kód předmětu KGZB/AGZ
Organizační forma výuky bez kontaktní výuky
Úroveň předmětu Doktorský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 0
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Čítek Jindřich, prof. Ing. CSc.
Obsah předmětu
Význam genomiky hosp. zvířat; Deskriptivní genomika (vazbové mapy - účel, princip konstrukce, používané genetické markery a jejich hodnocení a testování (PCR_RFLP, mikrosatelity, jednonukleotidové polymorfismy, mikročipy, programy používané ke konstrukci, databáze); Cytogenetické mapy (nomenklatura a karyotypy, hybridizace in situ, somatické hybridní buňky, Zoo-FISH, databáze), komparativní mapy (princip, nomenklatura, použití, databáze), RH mapy (princip konstrukce, význam, databáze), fyzické mapy (konstrukce kontigů), sekvenování genomu hosp. zvířat (organizace genu a genomu, princip sekvenování, současný stav a význam, databáze sekvencí, programy na jejich porovnávání). Principy mapování QTL u skotu a prasat(používané populace, současný stav, databáze, typy genetických markerů, selekce pomocí markerů).

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
  • Semestrální práce - 90 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 50 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 50 hodin za semestr
  • Účast na výuce - 56 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem genomiky hospodářských zvířat je identifikace genů podmiňujících fenotypovou variabilitu užitkových znaků a vlastností za účelem jejich manipulace v populacích pomocí selekce s využitím markerů (MAS).
Student se dovede samostatně orientovat v dané problematice a získané poznatky je schopen využít při své vědecké činnosti či další praxi.
Předpoklady
Student je se orientuje v problematici v rozsahu VŠ studia a je ochoten samostatně studovat.

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška

Znalosti genetiky živočichů.
Doporučená literatura
  • Brown, T. A. Genomes. Oxford, Bios Scientific Publishers 1999, 450 s..
  • Dunham, I. Genome Mapping and Sequencing. Norfolk, Horizon Scientific Press 2003, 470 s.
  • Georges, M. Introductory Genomics. Liége, C.B. I.G. & Fac. Vet. Med., University of Liége 2004, 140 s..
  • Georges, M. Modern Genetics for Veterinarians and the Animal Sciences. Liége, University of Liége 2002.
  • Hunt, S. P., Livesey, F. J. Functional Genomics. Oxford, Oxford University Press 2000, 250 s..
  • Ruvinsky, A. & Marshal Graves, J.A. (ed.). Mammalian Genomics. Cambridge, MA, USA, CAB International 2005, 600 s..


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Fakulta zemědělská a technologická Studijní plán (Verze): Zemědělské biotechnologie (1) Kategorie: Zemědělství a lesnictví - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Fakulta zemědělská a technologická Studijní plán (Verze): Zemědělské biotechnologie (1) Kategorie: Zemědělství a lesnictví - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -