|
Vyučující
|
-
Beran Pavel, Ing. Ph.D.
-
Hejna Ondřej, Ing. Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah bloků přednášek a cvičení: 1. Operační systémy založené na GNU/Linux a základní orientace. 2. Programování v biologii a programovací paradigmata. 3. Přehled programovacích jazyků běžných v biologii. 4. Základní tok programu. 5. Proměnné a pole proměnných. 6. Řízení toku programu. 7. Iterace. 8. Funkce a rekurze. 9. Doplňky programovacích jazyků a interoperabilita. 10. Statistika v programování. 11. Databáze v programování. 12. Jednoduché programování pro biologickou praxi. 13.-14. Vytváření komplexnějších celků programů využitelných v biologii.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
- Účast na výuce
- 56 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 30 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 30 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 21 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Předmět je určen pro studenty s pokročilými znalostmi a zájmem o informatiku se zaměřením na zpracování biologických dat. Hlavní náplní předmětu bude analýza těchto dat pomocí vlastnoručně implementovaných algoritmů.
Předmět Informatika nemá žádnou prerekvizitu
|
|
Předpoklady
|
Ukázat na rozdíly i průniky mezi obecnou a aplikovanou etikou, vysvětlit význam obecné etiky pro aplikovanou etiku. Představit bioetiku jako subdisciplínu aplikované etiky, poukázat na problematiku moderní techniky a biotechnologií.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Kombinovaná zkouška
Aktivní účast studenta na cvičení, případně účast na seminářích. Plnění zadaných úkolů dle pokynů vyučujícího.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Lesk, A. M. Introduction to Bioinformatics, Oxford University Press. 2013.
-
Ramsden, J. Bionformatics, Pringer London Ltd., 2015.
-
Zvelebil, M. J., Baum, J. O. Understanding Bioinformatics, Taylor & Francis Inc, 2007.
|