|
Vyučující
|
-
Hypša Václav, prof. RNDr. CSc.
-
Čurn Vladislav, prof. Ing. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Specifika molekulárně biologických dat, jejich výhody a nevýhody. Získávání molekulárně biologických dat pro účely systematiky (sekvenování, RFLP, RAPD, AFLP, alozymy, mikrosatelity, SSCP, reasociační analýza, imunologické metody, proteinový fingerprinting). Zpracovávání získaných dat - fenetické a kladistické přístupy, distanční a znaková data, metody výpočtu distancí na základě různých typů znakových dat, konstrukce dendrogramů, UPGMA, NJ, ML, ME, porovnávání dvou dendrogramů, testování spolehlivosti jednotlivých větví dendrogramů (jackknifing, OUT-jakknifing, bootstrapping). Biologická interpretace výsledků. Získávání programů pro molekulární fylogenetiku.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
- Semestrální práce
- 90 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 50 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 50 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 56 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem předmětu je seznámit doktorandy se základními metodami a technikami molekulární fylogenetiky a s využitím molekulárně biologických dat v systematice a navazujících biologických oborech.
Student se dovede samostatně orientovat v dané problematice a získané poznatky je schopen využít při své vědecké činnosti či další praxi
|
|
Předpoklady
|
Student je se orientuje v problematici v rozsahu VŠ studia a je ochoten samostatně studovat.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
Standardní znalosti genetiky a statistiky
|
|
Doporučená literatura
|
-
Avise, J. C. Molecular Markers, Natural History and Evolution. New York, Chapman & Hall 1993, 684 s..
-
Graur, D., Li, W. H. Fundamentals of Molecular Evolution. Massachusetts, Sunderland Massachusetts 1999, 481 s..
-
Hillis, D. M., Moritz, C., Mable, B. K. Molecular Systematics. Sinauer Assocites, Inc., Massachusetts, Sunderland Massachusetts 1996, 655 s..
-
Li, W. H. Molecular Evolution. Sinauer Assocites, Inc., Massachusetts, Sunderland Massachusetts 1997, 487 s..
|