|
Vyučující
|
-
Čurn Vladislav, prof. Ing. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Strukturní a funkční genomika. Komparativní, populační genomika. Metagenomika. Chromozomová genomika. Nové metody analýzy a sekvenování genomu. Využití technik FCM a třídění chromozomů, techniky a postupy NGS. Analýza genomu a transkriptomu. 2. Organizace a struktura genomu. Mendelistická a molekulární genetika. Identifikace donorů genů/znaků. Mapování genomu, fyzické a cytogenetické mapování. Identifikace a izolace genů. 3. Metody editace genomu a studium funkce genů. Regulace genové exprese, metody studie genové exprese. Bioinformatika ve studiu genomu. 4. Genetické založení významných znaků u hlavních zemědělských plodin. Genomická selekce. Molekulární markerování. Microarrays technologie v genotypizaci SNP. Perspektivy, celogenomové sekvenování v genomové selekci. Systémy MAS a GS. GWAS a GEM přístupy. Asociativní transkriptomika.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
- Semestrální práce
- 60 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 50 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 56 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 50 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem předmětu je podat přehled o moderních trendech v molekulární genetice, analýze genů a genomů rostlin, genetické založení významných znaků a praktickém využití genomiky a molekulární genetiky.
Studenti se dovedou orientovat v problematice metod molekulární biologie a genetiky rostlin
|
|
Předpoklady
|
Standardní znalosti biologie a genetiky
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Kombinovaná zkouška
Absolvování laboratorní praxe, zvládnutí objemu učiva vymezeného pro zkoušku.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Gregory T. The Evolution of the Genome. Academic Press, 2004..
-
Lesk A. Introduction to Genomics. Oxford Univ. Press. 2017..
-
Ruvinsky A., Marshall Graves J. A. (eds.). Mammalian Genomics. Wallingford, Cambridge, CABI Publishing 2005..
-
Samuelsson, Tore. Genomics and bioinformatics: an introduction to programming tools for life scientists. Cambridge:Samuelsson, Tore. Genomics and bioinformatics: an introduction to programming tools for life scientists. Cambridge:Cambridge University Press, 2012..
-
Somers D. J. et al. Plant Genomics. Methods and Protocols. Springer. 2009..
-
Womack J. E. (ed.). Bovine Genomics. Willey-Blackwell, 2012..
|