Obsah přednášky: 1) Úvod - historie mikroskopie, typy mikroskopů, oko jako optická soustava 2) Klasická světelná mikroskopie - základy optiky, optická soustava, stavba mikroskopu, typy objektivů, Köhlerovo osvětlení, kontrasní techniky - pozorování v temném poli, fázový kontrast, Nomarski kontrast (DIC), Hoffmanův kontrast (HMC), Dodtův infračervený gradientový kontrast (DGC) 3) Fluorescenční mikroskopie - princip, přehled fluoroforů, typy fluorescenčních mikroskopů, využití 4) Konfokální mikroskopie - princip, typy konfokálních mikroskopů včetně multiple-beam, multifotonové, TIRF, HILO a light-sheet fluorescenční mikroskopie 5) Pokročilé metody fluorescenční mikroskopie v biologickém výzkumu - FRAP, FRET (PIE), FLIM, FCS (Mgr. Tomáš Fessl, Ph.D.) 6) Techniky optické mikroskopie na bázi nelineárních optických jevů (Mgr. Josef Lazar, Ph.D.) 7) Superrezoluční techniky - 4PI, STED, GSDIM, SIM, FPALM, PALM, STORM, SLIM, NSOM 8) Luminiscenční mikroskopie - princip, využití 9) Způsob detekce světelného signálu - CCD, CMOS, EM-CCD, iCCD kamery, fotonásobiče 10) Vhled do elektronové mikroskopie (RNDr. Marie Vancová, Ph.D.) 11) Techniky makrofotografie (Doc. RNDr. František Weyda, CSc.) 12) Analýza digitálního obrazu - snímání a digitalizace obrazu, bitmapy, velikost, rozlišení, komprese a barva obrazu (RGB, CMYK), formáty rastrových souborů Obsah cvičení: 1) Praktická ukázka seřízení mikroskopu (Köhlerovo osvětlení, Nomarski kontrast) - (Laboratoř mikroskopie a histologie EntÚ, AV ČR) 2) Ukázka práce na fluorescenčním mikroskopu - (Laboratoř mikroskopie a histologie EntÚ, AV ČR) 3) Ukázka práce na konfokálním mikroskopu a analýza obrazu v programu IMARIS - (Laboratoř mikroskopie a histologie EntÚ, AV ČR) 4) Demonstrace technik TIRF, HILO, SMFD (Mgr. Alexey Bondar, Ph.D.) - (Budweis Single-Molecule Group, PřF JU, budova C - místnost 01037) 5) Demonstrace technik FRAP, FRET (Mgr. Tomáš Fessl, Ph.D., Mgr. Alexey Bondar, Ph.D.) - (Budweis Single-Molecule Group, PřF JU, budova C - místnost 01037) 6) Demonstrace superrezolučních technik STORM a SRRF (Mgr. Tomáš Fessl, Ph.D., Mgr. Alexey Bondar, Ph.D.) - (Budweis Single-Molecule Group, PřF JU, budova C - místnost 01037) 7) Ukázka práce na luminiscenčním mikroskopu - (Laboratoř mikroskopie a histologie EntÚ, AV ČR) 8) Exkurse do Laboratoře elektronové mikroskopie (RNDr. Marie Vancová, Ph.D.) - (Laboratoř elektronové mikroskopie ParÚ, AV ČR) 9) Ukázka zhotovení makrofotografie (Doc. RNDr. František Weyda, CSc.) 10) Analýza obrazu v programu Adobe Photoshop_část 1 - (Počítačová učebna JU) 11) Analýza obrazu v programu Adobe Photoshop_část 2 - (Počítačová učebna JU)
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Pozorování, Demonstrace, Exkurze, Práce s multimediálními zdroji (texty, internet, IT technologie), Praktická výuka
- Účast na výuce
- 50 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 30 hodin za semestr
- Exkurze
- 5 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 20 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 40 hodin za semestr
|