| Název předmětu | Advanced methods of molecular biology 2 |
|---|---|
| Kód předmětu | KMB/602E |
| Organizační forma výuky | Cvičení |
| Úroveň předmětu | Doktorský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Četnost výuky | V každém akademickém roce, jen v letním semestru. |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 4 |
| Vyučovací jazyk | angličtina |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Dostupnost předmětu | Předmět je nabízen přijíždějícím studentům |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
Studenti vyberou 2-3 z uvedených praktických metod: 1. Analýza exprese qPCR (Adam Bajgar) 2. Pokročilá genetika drozofily - tvorba a analýza mitotických klonů (Tomáš Doležal) 3. Systémová RNAinterference u hmyzu (David Doležel) 4. Mikroinjekce a imunofluorescenční barvení myších embryí (Alexander Bruce) 5. Fluorescenční in situ hybridizace (Petr Nguyen) 6. Průtoková cytometrie a cell sorter (Tomáš Korytář) 7. Detekce modifikací RNA afinitní gelovou elektroforézou (Zdeněk Paris) 8. 2D nativní / SDS elektroforéza kombinovaná s imunodetekcí (Roman Sobotka) 9. Exprese a purifikace proteinů označených His tagem (Roman Sobotka) 10. Klasické histologické techniky a světelná mikroskopie (Hana Sehadová) 11. Detekce respiračních komplexů s vysokou molekulovou hmotností pomocí nativní PAGE a následné analýzy western blotem (Alena Zíková) 12. Měření mitochondriálního dýchání pomocí vysokorozlišovací respirometrie (HRR) pomocí O2k-FluoRespirometru (Eva Doleželová) 13. Western blot v hmyzích tkáních a buněčných liniích (Marek Jindra) 14. Zpracování dat Next generation sequencing (Petr Nguyen) 15. Příprava knihovny pro RNAseq a analýza dat (Lenka Gahurová, Iva Mozgová) 16. Transfekce hmyzích buněčných linií (Michal Žurovec)
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Pozorování, Demonstrace, Laboratorní práce, Pokus
|
| Výstupy z učení |
|
Cílem předmětu je poskytnout praktické zkušenosti s vybranými pokročilými technikami molekulární biologie.
Absolvent tohoto kurzu by měl rozumět na detailnější bázi většině metod molekulární biologie a jejich širokému využití. Absolvent by měl být schopný samostatně přistupovat k výběru metod potřebných k řešení daných biologických otázek. Absolventi by měli být schopni poradit metodicky i jiným studentům jaké metody použít, jaké jsou výhody a rizika těchto přístupů. |
| Předpoklady |
|
Student by měl mít dobrou představu o celém spektru molekulárních metod a jejich principiálnímu používání. Měl by být obeznámen s fungováním buňky a základy molekulární a vývojové biologie a genetiky.
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Analýza výkonů studenta, Rozbor produktů pracovní činnosti studenta (technické práce)
Pro úspěšné absolvování praktik je nutné se zúčastniť 2 vybraných praktik v plném rozsahu. |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Infekční biologie (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Infekční biologie (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Fyziologie a vývojová biologie (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Molekulární a buněčná biologie a genetika (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Fyziologie a vývojová biologie (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Molecular and Cell Biology and Genetics (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Parasitology (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Molecular and Cell Biology and Genetics (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Parazitologie (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Infection Biology (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Parazitologie (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Physiology and Developmental Biology (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Molekulární a buněčná biologie a genetika (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Physiology and Developmental Biology (1) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |