|
Vyučující
|
-
Štefka Jan, doc. RNDr. Ph.D.
-
Nazarizadeh Dehkordi Masoud
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášek: Historie a obecné koncepty, od Mendela ke genomice. Variabilita populací (diverzita), měřítka diverzity, matematika pravděpodobností v populační genetice. Hardy-Weinbergova rovnováha, dominance-recesivita a Snyderovy podíly. Odchylky od HW, Vazebná nerovnováha. Genetický drift a struktura populací, malé populace, efektivní velikost, Wahlundův efekt, Fst. Nenáhodne oplození a inbreeding, genotypové četnosti, koeficient inbreedingu a vztah k Fst. Zdroje HW nerovnováhy, mutace a migrace. Neutrální teorie molekulární evoluce, neutrální vs. mírně nevýhodná mutace. Selekce a její projevy v populacích, mutačně-selekční rovnováha, modely infinite sites a infinite alleles. Kvantitativní genetika, fenotypová plasticita a dědičnost, QTL. Mikroevoluce a populační genomika, populační struktura a testy selekce pomocí genomických dat. Obsah cvičení - procvičování základních principů a statistik manuálně a v populacně genetických SW (genepop, R, atd.)
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Demonstrace
- Domácí příprava na výuku
- 60 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 54 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 20 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 40 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Smyslem přednášky je poskytnout podrobné informace o obecných zákonitostech genetické struktury přírodních populací a jejím dopadu na polymorfismus a fenotypovou diverzitu v populacích, o metodách studia genetické struktury populací, o rovnováze v populacích a procesech vedoucích k jejím změnám a o genetických příčinách evoluce populací (mikroevoluce).
Student si osvojí teoretické znalosti principů populační genetiky a analytické přístupy, kterými lze charakterizovat průběh mikroevolučních procesů.
|
|
Předpoklady
|
Základní porozumění principům molekulární biologie a dědičnosti. Doporučené přednášky: Genetika, nebo Genetika I a II.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Test
Požadavky ke zkoušce: složení písemného testu min. na 50%. Požadavky k zápočtu: správný výpočet několika příkladů ze cvičení.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Hamilton M. B. (2009) Population genetics, 1st ed. Wiley - Blackwell, Chichester, West Sussex, UK..
-
Hartl D. L. & Clark A. G. (1997, 2007) Principles of Population Genetics, 3rd, 4th ed. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts..
-
Hedrick P. W. (2005): Genetics of populations, 3rd ed. Jones and Bartlett, Sudbury, Massachusetts..
-
Nei M. (2013) Mutation-Driven Evolution, 1st ed. Oxford University Press, Oxford, UK..
|