|
Vyučující
|
-
Štefka Jan, doc. RNDr. Ph.D.
-
Damnjanović Dragomir
-
Robovský Jan, RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášky: Zaměření oboru: Biodiverzita a úbytek druhů, genetická diverzita a vymírání. Evoluční biologie a ochrana přírody: lidská činnost a evoluční procesy, detekce, výběr a ochrana evolučních jednotek. Zdroje dat pro detekci evolučních jednotek. Genetická variabilita: polymorfní lokusy, očekávaná vs. obdržená variabilita, kvantitativní aditivní variabilita a genetické mapování. Variabilita v měnícím se prostředí: Fragmentace habitatů a bariéry genového toku, inbreeding, migrace, efektivní velikost populace, překryv generací, demografie a extinkce. Geny pod selekcí: Variabilita MHC u jednotlivých skupin obratlovců, imunogenetika, patogeny a parazité, lokální adaptace - Fst, Qst. Populace a forenzní genetika: identifikace jedinců, testování pohlaví a rodičovství, testy pravděpodobnosti. Genomika v ekologii a ochraně přírody: získávání dat, genomika nemodelových organismů, SNP genotyping, kvantitativní lokusy (QTL), genová exprese. Invazní druhy: genetika introdukovaných organismů, vzájemné interakce s původními organismy včetně kompetice a hybridizace. Management ohrožených populací: dlouhodobé přežití populací, antropogenická hybridizace, reintrodukce, translokace. Ohrožené organismy v lidské péči: genetika a management (inbreedingová a outbreedingová deprese, simulace přežívání populace, pomocné nástroje - kryobanky, umělé inseminace apod.). Obsah cvičení: Cvičení budou zaměřena na implementaci teorie do praxe formou seznámení se s vybranými metodami analýzy dat na PC a praktickými ochranářskými přístupy k populacím v přírodě a v lidské péči (zoo, semi-rezervace apod.). Studenti dále navrhnou, zpracují a odprezentují vlastní vzorové projekty (výběr zájmového organismu, analýza dat, návrh managementu) na aktuální témata z médií, chovatelské praxe (zoo) a literatury. Literatura Allendorf & Luikart: Conservation and the Genetics of Populations Frankham et al.: Introduction to conservation genetics
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Demonstrace
- Domácí příprava na výuku
- 60 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 60 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 54 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Seznámit studenty s populačně genetickými a genomickými metodami a uplatňujícími se v ochraně populací a druhů. Obecné přístupy budou demonstrovány na konkrétních příkladech z praxe.
Student si osvojí základy populační genetiky, které mohu být využitelné pro jeho vědeckou a/nebo ochranářskou či chovatelskou činnost, student získá kritický nadhled nad typem a kvalitou používaných dat a jejich interpretací.
|
|
Předpoklady
|
Základní porozumění pricipům genetiky. Doporučené (ale ne povinné) kurzy: Genetika nebo Genetika I a II, Populační genetika
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Esej, Test
Požadavky k absolvování zkoušky: test na min. 50% Požadavky k absolvování cvičení: 10 až 15 minutová prezentace miniprojektu s analýzou genetických dat metodami vyučovanými na cvičeních.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Allendorf, F.W. and G. Luikart. Conservation and the Genetics of Populations. . Blackwell, 2007.
-
Bertorelle G, Bruford MW, Hauffe HC et al (eds). Population genetics for animal conservation. Cambridge University Press. Cambridge, 2009.
-
Frankham R., Ballou J.D., Briscoe D.A. Introduction to conservation genetics. Cambridge University Press, Cambridge, 2002.
-
Witzenberger KA, Hochkirch A. Ex situ conservation genetics: a review of molecular studies on the genetic consequences of captive breeding programmes for endangered animal species. 2011.
|