Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Studijní programy a katalog předmětů
pro akademický rok 2025/2026
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
English
Hledání

Předmět: Molekulární ekologie

« Zpět
Název předmětu Molekulární ekologie
Kód předmětu KZO/412
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V každém akademickém roce, jen v zimním semestru.
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 6
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinný, Povinně-volitelný
Způsob výuky nespecifikováno
Studijní praxe nespecifikováno
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Dehkordi Masoud Nazarizadeh
  • Štefka Jan, doc. RNDr. Ph.D.
  • Hypša Václav, prof. RNDr. CSc.
Obsah předmětu
Obsah přednášky: Podstata molekulární ekologie, otázky a jevy studované v rámci molekulární ekologie: Populační struktura (základy populační genetiky), speciace, migrace, reprodukční strategie (inbreeding, poměr pohlaví), demografické jevy (expanze, bottlenecky). Molekulární zdroje informací (markery) a metody jejich zpracování: Charakteristika, dostupnost a informační hodnota molekulárních markerů (sekvence DNA, jaderná vs. mitochondriální/plastidová DNA, kódující vs. nekódující DNA, mikrosatelity, AFLP, SNP). Statistické vs. simulační analýzy dat (MCMC). Základy populační a evoluční genetiky: Vnitrodruhová genetická a fenotypová variabilita, Hardy-Weinbergova rovnováha, neutrální teorie, genetický drift, molekulární hodiny. Měření genetické variability v populacích a mezi populacemi, metapopulace. Genealogické vs. fylogenetické vztahy: Štěpení populací a jejich genetická diferenciace, koalescenční teorie, ancestrální polymorfismus, concerted evolution, hybridizace. Demografické jevy: Efektivní velikost populace, expanze populací, bottleneck, migrace. Kin selection. Reprodukční strategie: poměr pohlaví, "mating" systém, inbreeding, sociální a hnízdní paraziti. Speciace, fylogeografie, koevoluce: Speciační proces, vymezení druhu, šíření druhů a metody fylogeografické analýzy, introdukce. Závislost genetické diverzity na geografické vzdálenosti, nested clade analysis. Koevoluce mezi nepříbuznými druhy organizmů a metody analýzy. Genomové mapování: Detekce genů podléhajících pozitivní a "balancing" selekci. Geny ovlivňující kvantitavní znaky (QTL). Ekologicky podmíněné změny v genomech (degenerace genomů, horizontální přenos genetické informace). Aplikované aspekty molekulární ekologie: Studium biodiverzity, barcoding, molekulární ekologie v ochraně ohrožených organismů, molekulární mikrobiologie a epidemiologie. Nové metody a programy v molekulární ekologii. Obsah cvičení: Praktická demonstrace metod a software k problémům jednotlivých přednášek

Studijní aktivity a metody výuky
Skupinová výuka
Výstupy z učení
Cílem předmětu je seznámit studenty s důsledky ekologických a evolučních procesů na molekulární charakteristky organismů (genetická struktura populací, změny v genomu) a s metodami studia ekologických otázek pomocí molekulárních informací.
Studenti jsou seznámeni se základy využití metod a konceptů molekulární ekologie v kontextu ostatních biologických disciplín. Zvyšuje se tak jejich způsobilost při řešení ekologických a evolučních otázek v širokém spektru biologických oborů.
Předpoklady
Předmět nemá žádné povinné prerekvizity, je úvodem do tématu. Pro jeho pochopení je výhodou absolvování a znalost některé z ekologických , či evolučních přednášek.

Hodnoticí metody a kritéria
Písemná zkouška

Úspěšné zvládnutí kurzu podmiňují: 1. Aktivní zapojení do diskuze v rámci jednotlivých přednášek 2. Aktivní účast na cvičeních a prokazatelné zvládnutí práce se softwary pro demonstrované analýzy. 3. Písemná zkouška látky probírané v kurzu: Student skládá písemnou zkoušku zahrnující otázky ze všech jednotlivých kapitol. Požadavkem nutným ke splnění zkoušky je alespoň částečné zodpovězení (tedy do úrovně klasifikačního stupně 3) nadpoloviční většiny otázek.
Doporučená literatura
  • Beebee T., Rowe G.: Molecular evolution. Oxford university press, 2005..
  • Christansen FB. : Theories of population variation in genes and genomes. Princeton university press, 2008..
  • Mayhew P.: Discovering evolutionary ecology. Oxford university press, 2006..
  • Templeton A.: Population genetics and microevolutionary theory. Wiley-Liss, 2006..


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, data aktuální k: 06.06.2025 23:50. Data byla vytvořena pro akademický rok 2025/2026