|
Vyučující
|
-
Hypša Václav, prof. RNDr. CSc.
-
Nováková Eva, doc. RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsahem teoretické a praktické části kurzu jsou následující témata: -vlastnosti a informativnost molekulárních dat -Maximální parsimonie -modely molekulární evoluce -distanční metody -Maximum likelihood -Bayesianská pravděpodobnost -alignmenty a matice -fylogenetika na populační úrovni: vnitrodruhové genealogie a koalescence -fylogeografie a koevoluce -alternativní přístupy a zdroje dat v molekulární fylogenetice
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Skupinová výuka
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem kurzu je seznámit posluchače se základními metodami a technikami molekulární fylogenetiky a s využitím molekulárně biologických dat v systematice a navazujících biologických oborech.
Studenti jsou seznámeni se základy využití metod a konceptů molekulární fylogenetiky v kontextu ostatních biologických disciplín. Zvyšuje se tak jejich způsobilost při řešení širokého spektra ekologických a evolučních otázek v širokém spektru biologických oborů.
|
|
Předpoklady
|
Předmět nemá žádné povinné prerekvizity, je úvodem do tématu. Pro jeho pochopení je výhodou absolvování a znalost některé ze systematických, či evolučních přednášek.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška
Úspěšné zvládnutí kurzu podmiňují: 1. Aktivní zapojení do diskuze v rámci jednotlivých přednášek 2. Aktivní účast na cvičeních a prokazatelné zvládnutí práce se softwary pro fylogenetické analýzy 3. Písemnáí zkouška látky probírané v kurzu: Student skládá písemnou zkoušku zahrnující otázky ze všech jednotlivých kapitol. Požadavkem nutným ke splnění zkoušky je alespoň částečné zodpovězení (tedy do úrovně klasifikačního stupně 3) nadpoloviční většiny otázek.
|
|
Doporučená literatura
|
-
D. Graur, W. H. Li Fundamentals of Molecular Evolution. Sunderland Massachusetts, 1999.
-
D. M. Hillis, C. Moritz and B. K. Mable Molecular Systematics. Sinauer Assocites, Inc., Sunderland Massachusetts, 1996.
-
Další materiály (včetně obrázků) je také na adrese http://www. natur. cuni. cz/.
-
flegr/.
-
J. C. Avise Molecular Markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York, 1993.
-
W. H. Li Molecular Evolution. Sinauer Assocites, Inc., Sunderland Massachusetts, 1997.
|