| Název předmětu | Fylogenetika |
|---|---|
| Kód předmětu | KZO/595 |
| Organizační forma výuky | Přednáška |
| Úroveň předmětu | Bakalářský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Četnost výuky | V každém akademickém roce, jen v letním semestru. |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 3 |
| Vyučovací jazyk | čeština |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
Obsah přednášek: Historie fylogenetiky, doba gerontokratická, vznik a krize numerické taxonomie. Vznik kladistiky, numerická kladistika, "pattern-cladistics", odumření klasické "evoluční taxonomie" (Mayr, Simpson a spol.). Molekulární fylogenetika, fenetické, kladistické a "probabilistické" trendy. Kladistická teorie, homologie, homoplazie, konflikt znaků a parsimonie, synapomorfie. Monofylie, polyfylie a parafylie, sesterské skupiny, ancestor-descendent. Kódování znaků, určení polarity znaků. Algoritmy budování kladogramů, statistika (bootstrapping, jackinfing, Bremerův index, PTP, DD apod.). Alternativy parsimonní analýzy: kompatibilitní analýza, "maximum likelihood", bayesovská analýza, "three-taxon statements"; vážení znaků; consensus tree, supertree. Molekulární systematika - alignment, kódování inzerčních a delečních změn. Fylogeneze a její evoluční interpretace; druh a speciace; fylogeneze a ontogeneze. Fylogeneze a paleontologie. Historická biogeografie. Evoluce ekologických a etologických znaků, historická ekologie. Fylogenetika a formální klasifikace. Obsah cvičení:
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
|
| Výstupy z učení |
|
Absolvent ovládá obecnou metodologii i konkrétní techniku fylogenetického a systematického výzkumu
Absolvent ovládá obecnou metodologii i konkrétní techniku fylogenetického a systematického výzkumu |
| Předpoklady |
|
žádné speciální požadavky
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Ústní zkouška
získat min. 60 % bodů v ústní zkoužce |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr |
|---|