|
Vyučující
|
-
Vácha František, prof. RNDr. Ph.D.
-
Kutá Smatanová Ivana, prof. Mgr. Ph.D.
-
Kutý Michal, Mgr. Ph.D.
-
Kaščáková Barbora, Mgr. Ph.D.
-
Havlíčková Petra, RNDr.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášek: Chemická struktura a geometrie, konformace a energie (Michal Kutý) Struktura proteinů (Ivana Kutá Smatanová, Michal Kutý) Struktura nukleových kyselin (Tomáš Fessl) Struktura polysacharidů a biologických membrán (František Vácha) Výpočetní metody a molekulové modelování (Zdeněk Futera) Rentgenová krystalografie (Pavlína Řezáčová) Nukleární magnetická resonance (Vašek Veverka) Elektronová mikroskopie (Zdenko Gardian) Hmotnostní spektroskopie (Filip Dyčka, Peter Koník) Absorpční a fluorescenční spektroskopie (Radek Litvín) Optická mikroskopie a CD (Tomáš Fessl) Nové trendy ve strukturní biochemii (Ivana Kutá Smatanová) Obsah cvičení: (Barbora Kaščáková, Petra Havlíčková) V průběhu cvičení budou prohloubeny znalosti získané v průběhu přednášek. Řešení struktury vybraného proteinu, vizualizace pomocí programu Pymol, použití program pro predikci struktur (AlphaFold)
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Práce s textem (učebnicí, knihou), Individuální konzultace s vyučujícím
- Příprava na zápočet
- 14 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 14 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 56 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Přednášky pro studenty přiblíží důvod, proč je důležité porozumět funkci makromolekulárních struktur na molekulární úrovni. V moderní biochemii došlo k průlomu s rozvojem technik, jako jsou XRD, NMR a EM, které umožňují určovat struktury makromolekul. Dnes běžně studenti využívají strukturní modely proteinů a nukleových kyselin dostupné v počítačových databázích. Tyto modely poskytují názornou, avšak často idealizovanou reprezentaci biologických makromolekul. Proto je klíčové, aby se studenti moderní biochemie v průběhu svého studia seznámili s metodami strukturní analýzy. Tím budou schopni rozlišit mezi tím, co bylo naměřeno a co bylo vypočteno a tím lépe porozumět rozdílu mezi realitou a modelem.
Absolventi kurzu získají teoretické znalosti z oblasti funkční a strukturní biochemie a také praktické dovednosti zahrnující použití různých metodologických postupů a využití mnoha moderních instrumentálních metod při studiu struktury a funkce živých organizmů na molekulární úrovni.
|
|
Předpoklady
|
Minimálním požadavkem na studenty jsou základní znalosti chemie a biochemie získané po ukončení vysokoškolského vzdělání biologického, chemického nebo biochemického zaměření.
UCH/100 a zároveň UCH/101 a zároveň KCH/OCH1C a zároveň KCH/OCH2C a zároveň UCH/032
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška, Kombinovaná zkouška
Zápočet bude udělen na základě krátké přednášky o odborném článku, který studenti dostanou k nastudování. Závěrečná zkouška bude mít formu ústního pohovoru s finálním hodnocením formou udělení známky.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Kensal E. van Holde, W. Curtis Johnson, P. Shing Ho: Principles of physical biochemistry 2nd ed. Pearson Education, Inc. (2006), ISBN 0-13-046427-9.
-
Žídek, L. a kol.: Strukturní biochemie, MU Brno, 2015.
|