|
Vyučující
|
-
Šimek Petr, RNDr. CSc.
-
Hill Martin, Ing. CSc.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášky: Přednáška bude ve dvou blocích. 1. Úvod do metabolomiky: Metabolomika jako obor systémové biologie, strategie analýzy metabolitů - příprava vzorku, hlavní charakteristiky biologických materiálů, strategie analýzy metabolitů - instrumentální analýza, nástroje ke zpracování dat, databáze metabolitů, metabolické dráhy, metabolomika tělních tekutin a výživy. 2. Chemometrie-informatika v metabolomice: jednorozměrný výběr, vztahy mezi metrickými proměnnou a nemetrickými proměnnými, t-testy, jednofaktorová ANOVA, vztahy mezi metrickými proměnnými, vztahy mezi metrickou závisle proměnnou a metrickými nezávisle proměnnými, lineární regrese, vztahy mezi metrickou závisle proměnnou a metrickými i nemetrickými nezávisle proměnnými, vztahy mezi nemetrickou závisle proměnnou a metrickými i nemetrickými nezávisle proměnnými, vztahy mezi nemetrickými proměnnými, vícerozměrné metody, analýza hlavních komponent, rotace faktorů, analýza shluků, SW nástroje pro chemometrii a metabolomiku - Excel, Statgraphics, Statistica, NCSS, SIMCA; praktické aplikace chemometrických/informatických metod v metabolomice.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
- Účast na výuce
- 64 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 10 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 15 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Seznámit posluchače se základy chemometrických přístupů ve vztahu k nejdůležitějším metodám analýzy metabolitů
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
Další informace: K výuce je potřeba počítačová učebna s přístupem posluchače k počítači se základním programovým vybavením a statistickým programem
|
|
Doporučená literatura
|
-
M. Meloun, J. Militký, Kompendium statistického zpracování dat, Academia, 2002.
-
M. Meloun, J. Militký, M. Hill, Počítačová analýza vícerozměrných dat v příkladech, Academia, 200, recentní publikace.
-
M. Meloun, J. Militký, Statistická analýza experimentálních dat, Academia, 2004.
|