|
Vyučující
|
-
Věchtová Pavlína, RNDr. Ph.D.
-
Koník Peter, Mgr. Ph.D.
-
Kaščáková Barbora, Mgr. Ph.D.
-
Kahoun David, Ing. Ph.D.
-
Litvín Radek, doc. RNDr. Ph.D.
-
Gardian Zdenko, Ing. Ph.D.
-
Kutá Smatanová Ivana, prof. Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah cvičení: Každý student vypracuje vlastní vědecký miniprojekt, ve kterém bude testovat a charakterizovat vlastnoručně připravený vzorek pomocí uvedených metod. Na závěr vypracuje protokol, kde vyhodnotí výsledky a zhodnotí výhody a nevýhody jednotlivých experimentálních metod. 1. Purifikace peroxidázy z křenu srážením síranem amonným a ionexovou chromatografií s využitím TEAE Spheronu 2. Izolace RNA 3. Stanovení exprese genu pro peroxidázu 4. Identifikace proteinu pomocí LC-MS/MS 5. Krystalizace modelového proteinu lysozymu 6. Kvalitativní analýza aminokyselin metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie s ionizací vyhřívaným elektrosprejem a s tandemovou hmotnostní detekcí (HPLC-HESI-MS/MS) 7. Použití spektrálních metod k charakterizaci vzorku - Cirkulární dichroismus 8. Elektronová mikroskopie 9. Vyhodnocení výsledků 10. Zpracování a prezenatce projektu
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Práce s textem (učebnicí, knihou), Demonstrace, Laboratorní práce, Pokus, Individuální konzultace s vyučujícím
- Účast na výuce
- 60 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 20 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 20 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Laboratorní cvičení budou zaměřena na praktickou aplikaci všech metod, které byly samostatně probírány v průběhu přednášek prvního a druhého semestru magisterského studia oboru.
Absolventi kurzu se prakticky seznámí experimentálními metodami, které se používají při strukturně-funkčních studiích proteinů a makromolekulárních komplexů od přípravy vzorků, přes jejich testování až po strukturní studie.
|
|
Předpoklady
|
Minimálním požadavkem na studenty je znalost obecné a organické chemie a biochemie a základy laboratorní praxe.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Rozhovor, Vypracování laboratorních protokolů
Student dostane zápočet po odevzdání laboratorních protokolů a následné konzultaci získaných výsledků.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Viz sylaby jednotlivých předmětů. / See course characteristics of individual subjects..
|