|
Vyučující
|
-
Durchan Milan, RNDr. CSc.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášky: Molekuly v kosmickém měřítku komplexnosti. Úloha bioprvků při vytváření struktur v organismech. Molekulární organisace biologických systému. Fyzikální vlastnosti vody a jejich biologický význam. Experimentální metody studia vodíkových vazeb. Gibbsova energie v molekulární biologii - rekapitulace základů chemické termodynamiky. Mezimolekulární interakce elektrostatické. Indukční, dispersní, vodíkové vazby. Spektroskopie molekulárních dimerů. Význam slabých chemických interakcí pro strukturu a funkci biologických molekul. Síly určující konformace bílkovin a nukleových kyselin. Hydrofobní efekt a solvatační jevy. Iontová interakce a sírové můstky v bílkovinách. Peptidová vazba a polypeptidový řetězec. Konformační analýza bílkovin: alfa-šroubovice, beta-list, polyprolin. Ramaeandranovy diagramy, potenciálové funkce, predikace struktur. Konformace nukleových kyselin. Base, cukry, rotační úhly. DNA - B,A a Z-forma. Konformační analýza nukleových kyselin.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Práce s textem (učebnicí, knihou), Demonstrace, Projekce (statická, dynamická), Individuální příprava ke zkoušce, Exkurze
- Exkurze
- 3 hodiny za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 5 hodin za semestr
- Semestrální práce
- 2 hodiny za semestr
- Účast na výuce
- 28 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Vyložit důležitost role konformací a mezimolekulových interakcí pro strukturu a funkci biologických makromolekul.
Studenti si prohloubí středoškolské znalosti z fyziky a mezioborových disciplín.
|
|
Předpoklady
|
Úvodní kurz z biofyziky, který má za cíl spíše obor popularizovat.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška, Seminární práce
Vlastní prezentace studenta na jedno z navržených témat, diskuse k tomuto tématu. Ústní zkouška.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Bruce Alberts: Základy buněčné biologie, Úvod do molekulární biologie buňky, Espero Publishing, Ústí nad Labem, 2001.
-
J.David Rawn: Biochemistry, Neil Patterson Publishers, Burlington, N. Carolina, 1989.
-
Pavel Hobza, Rudolf Zahradník: Mezimolekulové komplexy - Úloha van der Waalsových systému ve fyzikální chemii a v biodisciplinách, Academia, Praha 1988.
-
Zdeněk Vodrážka: Fyzikální chemie pro biologické vědy, Academia, Praha 1982.
|