Vyučující
|
-
Vancová Marie, RNDr. Ph.D.
-
Kaftan David, Mgr. Ph.D.
-
Gardian Zdenko, Ing. Ph.D.
-
Bílý Tomáš, Mgr. Ph.D.
|
Obsah předmětu
|
Přednášky: Vizualizace biologických makromolekul ve vysokém rozlišení. Kvalitativní a kvantitativní mikroanalýza biologických objektů v elektronových mikroskopech. Progresivní metody přípravy preparátů. Pokročilé metody imunoznačení. 3D elektronová mikroskopie Elektronová tomografie: od přípravy preparátů po 3D vizualizaci. CLEM = korelativní světelná a elektronová mikroskopie Sondové mikroskopie (AFM, STM) a jejich biologické aplikace. Praktika: 3D rekonstrukce biologického objektu pomocí elektronové tomografie. Jednočásticová analýza negativně kontrastovaného vzorku Kryo-krájení a imunolokalizace Demonstrace AFM mikroskopu
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Laboratorní práce
- Příprava na zápočet
- 24 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 28 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 24 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 24 hodin za semestr
|
Výstupy z učení
|
Přednášky: Imunoelektronová mikroskopie s neznačenými a značenými protilátkami a jejich aplikace. Kryometody v biologické elektronové mikroskopii. Elektronová tomografie. Visualizace biologických makromolekul. Autoradiografie. Obrazová analýza, trojrozměrné rekonstrukce v elektronové mikroskopii. Morfometrie a stereologie. Elektronová mikroanalýza (kvalita, kvantita) biologických objektů. Korelativní mikroskopie. Elektronová difrakce a její aplikační možnosti v biologii. Nové mikroskopie ( STM, AFM) a jejich biologické aplikace. Laboratorní cvičení: Příprava ultratenkých řezů, imunoznačení na řezech, identifikace krystalické struktury pomocí elektronové difrakce, určení velikosti částic v suspenzi pomocí SEM, zpracování měření v programu ACC.
Student získá přehled o pokročilých metodách elektronové a sondové mikroskopie a jejich využití v biologickém a biomedicínském výzkumu. Osvojí si znalosti o přípravě preparátů pro tyto pokročilé metody. Zorientuje se v buněčné ultrastruktuře a získají představu o možnostech detekce biomolekul. Studenti se dozví o možnosti využít elektronové mikroskopy ke kvantitativní a kvalitativní elektronové mikroanalýze.
|
Předpoklady
|
Zkouška z kurzu Electron Microscopy I
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Test
Vypracování protokolů z vybraných laboratorních cvičení. 60% správných odpovědí v závěrečné písemné zkoušce
|
Doporučená literatura
|
-
MJ Dykstra, LE Reuss: Biological Electron Microscopy ? Theory, Techniques and Troubleshooting. 2nd Edition..
-
Jana Nebesářová. Elektronová mikroskopie pro biology. Č.Budějovice, 2002.
-
John Kuo. Electron Microscopy. Springer Heidelberg, 2014. ISBN 978-1-62703-776-1.
|