Předmět: Electron Microscopy II

« Zpět
Název předmětu Electron Microscopy II
Kód předmětu UFY/EM2
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V každém akademickém roce, jen v letním semestru.
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 4
Vyučovací jazyk angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Dostupnost předmětu Předmět je nabízen přijíždějícím studentům
Vyučující
  • Vancová Marie, RNDr. Ph.D.
  • Kaftan David, Mgr. Ph.D.
  • Gardian Zdenko, Ing. Ph.D.
  • Bílý Tomáš, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Přednášky: Vizualizace biologických makromolekul ve vysokém rozlišení. Kvalitativní a kvantitativní mikroanalýza biologických objektů v elektronových mikroskopech. Progresivní metody přípravy preparátů. Pokročilé metody imunoznačení. 3D elektronová mikroskopie Elektronová tomografie: od přípravy preparátů po 3D vizualizaci. CLEM = korelativní světelná a elektronová mikroskopie Sondové mikroskopie (AFM, STM) a jejich biologické aplikace. Praktika: 3D rekonstrukce biologického objektu pomocí elektronové tomografie. Jednočásticová analýza negativně kontrastovaného vzorku Kryo-krájení a imunolokalizace Demonstrace AFM mikroskopu

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Laboratorní práce
  • Příprava na zápočet - 24 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 28 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 24 hodin za semestr
  • Účast na výuce - 24 hodin za semestr
Výstupy z učení
Přednášky: Imunoelektronová mikroskopie s neznačenými a značenými protilátkami a jejich aplikace. Kryometody v biologické elektronové mikroskopii. Elektronová tomografie. Visualizace biologických makromolekul. Autoradiografie. Obrazová analýza, trojrozměrné rekonstrukce v elektronové mikroskopii. Morfometrie a stereologie. Elektronová mikroanalýza (kvalita, kvantita) biologických objektů. Korelativní mikroskopie. Elektronová difrakce a její aplikační možnosti v biologii. Nové mikroskopie ( STM, AFM) a jejich biologické aplikace. Laboratorní cvičení: Příprava ultratenkých řezů, imunoznačení na řezech, identifikace krystalické struktury pomocí elektronové difrakce, určení velikosti částic v suspenzi pomocí SEM, zpracování měření v programu ACC.
Student získá přehled o pokročilých metodách elektronové a sondové mikroskopie a jejich využití v biologickém a biomedicínském výzkumu. Osvojí si znalosti o přípravě preparátů pro tyto pokročilé metody. Zorientuje se v buněčné ultrastruktuře a získají představu o možnostech detekce biomolekul. Studenti se dozví o možnosti využít elektronové mikroskopy ke kvantitativní a kvalitativní elektronové mikroanalýze.
Předpoklady
Zkouška z kurzu Electron Microscopy I

Hodnoticí metody a kritéria
Test

Vypracování protokolů z vybraných laboratorních cvičení. 60% správných odpovědí v závěrečné písemné zkoušce
Doporučená literatura
  • MJ Dykstra, LE Reuss: Biological Electron Microscopy ? Theory, Techniques and Troubleshooting. 2nd Edition..
  • Jana Nebesářová. Elektronová mikroskopie pro biology. Č.Budějovice, 2002.
  • John Kuo. Electron Microscopy. Springer Heidelberg, 2014. ISBN 978-1-62703-776-1.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr