Předmět: Matematická ekologie a epidemiologie

« Zpět
Název předmětu Matematická ekologie a epidemiologie
Kód předmětu UMB/340
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V každém akademickém roce, jen v zimním semestru.
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný, Volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Berec Luděk, doc. Ing. Dr.
  • Křivan Vlastimil, prof. RNDr. CSc.
Obsah předmětu
1. Matematické modelování v biologii 2. Populační dynamika: nestrukturované modely jedné populace, růst lidské populace 3. Populační dynamika: populace s věkovou strukturou, růstová rychlost, analýza sensitivity 4. Populační dynamika: modely těžby obnovitelných zdrojů, lov, kontrola škůdců 5. Metapopulační dynamika: modely jedné populace 6. Populační interakce: interakce dravec-kořist, funkční odpověď, refugia 7. Populační interakce: model kompetice, princip kompetitivní exkluze 8. Populační interakce: potravní sítě, trofická kaskáda 9. Dynamika infekčních nemocí: základní epidemický model, kontrola epidemie, rozšíření základního modelu 10. Dynamika infekčních nemocí: endemické nemoci, způsoby přenosu nemoci 11. Makro-parazitární infekce: obecný model, distribuce parazitů, stabilizující a destabilizující mechanismy, schistosomiáza 12. Infekcí přenášené přenašeči: obecný model, možnost eradikace infekce, lymská borelióza, Zika virus, West Nile virus 13. Dynamika infekčních nemocí: evoluce virulence, evoluce rezistence Součástí kurzu je práce s jednotlivými modely v prostředí R.

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Demonstrace, Projekce (statická, dynamická), Individuální příprava ke zkoušce
  • Účast na výuce - 28 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 28 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 28 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem kurzu je seznámit studenty se základy matematického modelování v ekologii, epidemiologii a dalších biologicky orientovaných oborech.
Matematická biologie je unikátní disciplínou na pomezí matematiky a biologie. Cílem matematické biologie je využít matematických nástrojů k pochopení, predikci a ovlivňování biologických jevů a procesů. Je tak komplementární k biologickým experimentům: pomáhá identifikovat mezery ve znalostech, experimenty vhodně nastavit, čerpá z výsledků dokončených experimentů, nahrazuje experimenty tam, kde je experimentování nemožné či nákladné či generuje hypotézy pro další experimentální práci. Student bude schopen vysvětlit výhody, ale také omezení matematického modelování v biologii, sestavit řadu jednoduchých modelů v ekologii, epidemiologii a dalších oblastech biologie, pracovat s těmito modely a analyzovat je, a také převést výsledky matematického modelování zpět to jazyka biologie.
Předpoklady
Základy matematické analýzy, lineární algebry a obyčejných diferenciálních rovnic.
UMB/CV587
----- nebo -----
UMB/587

Hodnoticí metody a kritéria
Rozhovor, Kombinovaná zkouška

vypracování zadaného individuálního projektu
Doporučená literatura
  • Keeling, Rohani. Modeling infectious diseases in humans and animals. Princeton University Press, 2008.
  • Kot. Elements of mathematical ecology. Cambridge University Press, 2001.
  • Vynnycky, White. An introduction to infectious disease modelling. Oxford University Press, 2010.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Aplikovaná matematika (2010) Kategorie: Matematické obory 3 Doporučený ročník:3, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Matematika pro vzdělávání (1) Kategorie: Matematické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Matematika pro vzdělávání (1) Kategorie: Matematické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Zimní