|
Vyučující
|
-
Revilla Rimbach Tomas Augusto, Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Modelování molekulární evoluce: maticové modely substituce bází. 2. Fylogenetické stromy: grafy, vzdálenost v grafu, alignment, maximum parsimony. 3. Genetika a přírodní výběr: Hardy-Weinbergovo equilibrium, modelování dynamiky selekce a mutace. 4. Biochemie: chemická kinetika, farmakokinetika a farmakodynamika, enzymatická dynamika. 5. Fysiologie: modely (Hodgkin-Huxley a Fitzhugh-Nagumo) vedení vzruchu 6. Genové a neuronové sítě.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Práce s multimediálními zdroji (texty, internet, IT technologie)
|
|
Výstupy z učení
|
Seznámit studenty s vybranými partiemi aplikací matematiky v biologii.
Student bude mít přehled o základních matematických modelech v biologii, bude je umět vytvářet, analyzovat a interpretovat.
|
|
Předpoklady
|
Prerekvizity: Úvod do diferenciálních rovnic, Pravděpodobnost a matematická statistika
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Analýza výkonů studenta, Kombinovaná zkouška, Průběžné hodnocení
Prezentace vybraného tématu, zkouška
|
|
Doporučená literatura
|
-
Allman, Elizabeth Spencer; Rhodes, John Anthony. Mathematical models in biology : an introduction. 1st ed. Cambridge : Cambridge University Press, 2004. ISBN 0-521-52586-1.
-
Bacaër, Nicolas. A Short History of Mathematical Population Dynamics. Springer London, 2011.
-
Batschelet, Edward. Introduction to mathematics for life scientists. 3rd ed. Berlin : Springer, 1979. ISBN 3-540-09648-5.
-
Bodine, Lenhart&Gross. Mathematics for the Life Sciences. 2014.
-
Edelstein-Keshet, Leah. Mathematical models in biology. 1st ed. Boston, MA : McGraw-Hill, 1988. ISBN 0-07-554950-6.
|