|
Vyučující
|
-
Boukal David, prof. Ing. MgA. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášky: Základní principy modelování v ekologii, stručný přehled dostupného software. / Populační a evoluční dynamika I: analýza maticových modelů, náhodné vlivy, aplikace v ochraně přírody a biologické kontrole, evoluce životních cyklů (R balík popbio). / Populační a evoluční dynamika II: spojité modely, trofické sítě (deSolve). / Modely a experimenty: fitování dat, vliv chyb pozorování (emdbook). / Vnitrodruhová a prostorová varibilita: metapopulace, optimalizace chování, agent-based modely (simecol). / Pokročilé vizualizace modelových simulací (ggplot2). Obsah cvičení: Přednáška a cvičení se prolínají, praktické příklady navazují na probranou teorii. Studenti během kurzu řeší zadané konkrétní úlohy na procvičení dovedností.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Práce s multimediálními zdroji (texty, internet, IT technologie), Projektová výuka
- Domácí příprava na výuku
- 30 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 48 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 40 hodin za semestr
- Semestrální práce
- 60 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Posluchači se v prostředí programu R seznámí s nejdůležitějšími principy a postupy modelování procesů v populační, behaviorální a evoluční ekologii. Důraz je kladen na praktické příklady s cílem umožnit studentům aktivní osvojení metod a jejich použití ve vlastní odborné práci.
Studenti získají dovednosti potřebné k samostatnému řešení vybraných ekologických problémů v prostředí programovacího jazyka R a jejich prezentaci formou rukopisu.
|
|
Předpoklady
|
Základní znalosti ekologie a základní zkušenost s prací v programu R. Prerekvizity - doporučené - Ekologie KBE 022, Základy moderních regresních metod nebo Moderní regresní metody KBE 785, Vizualizace dat KBE 782.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Rozbor produktů pracovní činnosti studenta (technické práce), Seminární práce
Úpěšné složení zkoušky je podmíněno předložením funkčního kódu v programu R řešícího vybraný problém a shrnutí výsledků psanou formou (základní struktura rukopisu vědecké práce v doporučeném rozsahu cca 4-8 stran A4).
|
|
Doporučená literatura
|
-
B.M. Bolker (2008) Ecological models and data in R. Princeton..
-
R. Hilborn, M. Mangel (1997) Ecological detective: confronting models with data. Princeton..
-
V. Grimm, S.F. Railsback (2005) Individual based modeling and ecology. Princeton..
|