Předmět: Procesní půdní mikrobiologie

» Seznam fakult » FPR » KBE
Název předmětu Procesní půdní mikrobiologie
Kód předmětu KBE/035
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení + Seminář
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V akademických rocích začínajících lichým letopočtem (např. 2019/2020), jen v zimním semestru.
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 6
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Bárta Jiří, doc. Ing. Ph.D.
  • Kaštovská Eva, doc. Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. 1-2. Úvodní přednášky představující specifika a komplexity půdního prostředí na různých úrovních a podobu a základní fungování buňky v takovém prostředí 3. Představení základních skupin půdních mikroorganismů, principy skupinového a funkčního dělení, základní zástupci skupin 4-5. Obecná diverzita metabolických drah spojených se ziskem energie v závislosti na podmínkách prostředí, fungování enzymů v půdním prostředí 6-7. Funkční skupiny mikroorganismů a klíčové metabolické procesy v cyklech C, N, P, S 8-9. Biomasa mikroorganismů, růst a obrat - efektivita využití substrátu, potřeba živin, stechiometrie, vliv vnějších faktorů, role v tvorbě a stabilizaci organické hmoty 10-11. Metody studia fungování mikrobiálních interakcí v půdě obecně a v půdních mikroprostředích 12-13. Presentace a diskuse výsledků ze cvičení Obsah cvičení/semináře: Studenti se v rámci cvičení seznámí s půdně-mikrobiologickými přístupy, jejichž principy byly vysvětleny během přednášek. Skupiny 2-3 studentů budou řešit projekty zaměřené na dílčí problematiku s cílem určit vliv daného faktoru prostředí na složení mikrobiálního společenstva a vybrané procesy mikrobního metabolismu. Jejich úkolem bude promyslet a založit experiment, provést měření a vyhodnocení výsledků. Ty odevzdají ve formě manuskriptu s dohodnutou strukturou a délkou a po schválení jej prezentují na závěrečném diskusním semináři.

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Demonstrace, Laboratorní práce, Pokus
  • Účast na výuce - 58 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 62 hodin za semestr
  • Semestrální práce - 30 hodin za semestr
Výstupy z učení
Kurz seznámí studenty s různorodostí ve složení mikrobiálního společenstva a mikrobiálního metabolismu v návaznosti na diverzitu půdního prostředí. Klíčové procesy cyklu uhlíku, dusíků a dalších prvků budou vztahovány k funkčním skupinám mikroorganismů a řídícím faktorům prostředí. Prezentovány budou také klasické i moderní metody půdní mikrobiologie a biochemie, umožňující popis fungování půdy i specifických půdních mikroprostředí a komplexních mikrobiálních společenstev. Studenti by po absolvování kurzu měli být schopní naplánovat a provést jednoduchá měření mikrobiální aktivity a interpretovat a diskutovat získané výsledky. Kurz je určen především studentům magisterského programu Biologie ekosystémů.
Student získá základní pokročilejší znalosti o procesech přeměn uhlíku a živin a o stabilizaci půdní organické hmoty. Pochopí základy mikrobiálního metabolismu, podmínky ovlivňující rychlost a efektivitu růstu mikrobiální biomasy a procesů dekompozice a mineralizace. Bude umět posoudit vliv změn fyzikálně chemických podmínek v půdě a prostředí na průběh těchto procesů a vyvodit důsledky pro fungování ekosystému.
Předpoklady
Předpokladem jsou základní znalosti půdní ekologie a obecné mikrobiologie, splněné absolvováním kurzů Ekologie půdy KBE/521 a Mikrobiologie KBE/260.

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška, Kombinovaná zkouška, Seminární práce

Podmínkou udělení zápočtu je absolvování praktických cvičení doplňující teoretickou část kurzu. Výsledky praktické úlohy studenti odevzdají (před konáním semináře) ve formě manuskriptu s předem danou strukturou a minimální délkou a prezentují na semináři formou 10 minutového příspěvku následovaného diskusí. To je podmínkou pro udělení zkoušky (50% známky). Zkouška je ústní, pro její složení je třeba zodpovědět 50% položených otázek.
Doporučená literatura
  • Cardon Z., Whitbeck J. 2007. The Rhizosphere: An ecological perspective. Academic Press, London.
  • Dix N. J., Webster J. 1995: Fungal Ecology. Chapman and Hall, London ..
  • Kirchman D.L. 2012. Processes in microbial ecology. Oxford University Press, New York.
  • Madigan M.T. et al. 2021. Brock Biology of Microorganisms 15th Ed., Prentice Hall, London.
  • Paul E. A., Clark F. E. 1996: Soil Microbiology and Biochemistry. Academic Press, London ..
  • van Elsas D., Jansson J.K., Trevors J.T. 2007. Modern Soil Microbiology. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr