Předmět: Advanced regression methods

» Seznam fakult » FPR » KBE
Název předmětu Advanced regression methods
Kód předmětu KBE/051E
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Doktorský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V akademických rocích začínajících sudým letopočtem (např. 2020/2021), jen v zimním semestru
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Šmilauer Petr, doc. RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Obsah přednášky: Lineární, zobecněné lineární a zobecněné aditivní modely; modely se smíšenými efekty - vnořené a (částečně) zkřížené náhodné efekty, modelování korelační struktury, GLMM, GAMM; analýza přežívání s náhodnými efekty, modely s nadměrnými a omezenými nulami, pokročilé regresní stromy a náhodné lesy, analýza fylogenetických dat, analýza bodových uspořádání; výběr modelu podle AIC, průměrování modelů; bootstrap metoda Obsah cvičení: Praktika jsou vzájemně proložena s přednáškami a doplňují vyučovanou teorii

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), E-learning
  • Příprava na zápočet - 28 hodin za semestr
  • Účast na výuce - 42 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 28 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 28 hodin za semestr
Výstupy z učení
Studenti si osvojí pokročilé postupy při modelování dat v přírodních vědách, s důrazem na modelu kombinující náhodné a pevné efekty a také na výběr složitosti modelu. Studenti získají schopnost práce s takovýmito statistickými modely nezávisle v rámci svého výzkumu. Důležitou součástí kurikula jsou domácí úkoly hodnocené přednášejícím.
Absolventi budou schopni se pro data pocházející z oborů přírodních věd správně rozhodnout o typu regresního modelu: podoba vysvětlujících proměnných a volba pevných vs. náhodných efektů, transformace škály vysvětlované a vysvětlujících proměnných, testování významností jednotlivých efektů a výběr vysvětlujících proměnných. Budou také schopni efektivně aplikovat pokročilé typy stromečkových modelů (např. boosted regression trees and regression forests). Naučí se aplikovat metody modelování fylogenetických korelací mezi jednotlivými taxony v oblasti srovnávací ekologie a správně použít neparametrické zobecněné aditivní modely (GAM a GAMM).
Předpoklady
Je předpokládána (a úvodním testem ověřována) základní znalost R, zejména práce s lineární regresí, ANOVA a GLM modely. Minimum B+C studentů - 5
KBE/050
----- nebo -----
KBE/785E

Hodnoticí metody a kritéria
Písemná zkouška, Průběžné hodnocení

Studenti by měli průběžně dodávané studijní materiály prostudovat před jejich probíráním s přednášejícím. Studentům jsou v průběhu semestru zadávány domácí úkoly (5-7), které jsou bodovány přednášejícím. Zápočet je založen na kombinaci bodů z úvodního testu (0-10) a bodů za domácí úkoly (1 bod za každé správné řešení úkolu). Součet bodů musí být alespoň 12. Zkouška je písemná, založená na dvou příkladech, s celkovým počet až 10 bodů. Pro úspěšné absolvování je třeba získat 4 a více bodů.
Doporučená literatura
  • A. Zuur et al. (2009): Mixed effect models and extensions in ecology with R. Springer..
  • K.P. Burnham, D.R. Anderson (1998): Model selection and multimodel inference, 2nd Edition, Springer..


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr