Předmět: Advanced ordination methods

» Seznam fakult » FPR » KBE
Název předmětu Advanced ordination methods
Kód předmětu KBE/052E
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Doktorský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V akademických rocích začínajících sudým letopočtem (např. 2020/2021), jen v letním semestru
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk angličtina
Statut předmětu Povinný, Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Šmilauer Petr, doc. RNDr. Ph.D.
  • Lepš Jan, prof. RNDr. CSc.
Obsah předmětu
Obsah přednášky: Shrnutí práce s programem Canoco. Pokročilé ANOVA modely pro opakovaná měření a odpovídající mnohorzměrné metody (3 týdny). Metoda Principal response curves (PRC); Ko-korespondenční analýza (CoCA), ordinační metody založené na vzdálenostech (PCoA, NMDS), práce s prostorovými daty (dbMEM, 2 týdny). Analýza vztahu mezi funkčními vlastnostmi a prostředím (2 týdny). Obsah cvičení: Doplňují obsah přednášek, poslední 2 týdny práce na projektech plus jejich prezentace

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Práce s textem (učebnicí, knihou), Demonstrace, Projekce (statická, dynamická), E-learning
  • Domácí příprava na výuku - 14 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 16 hodin za semestr
  • Semestrální práce - 16 hodin za semestr
  • Účast na výuce - 28 hodin za semestr
Výstupy z učení
Studenti se seznámi s teorií pokročilejších metod mnohorozměrné analýzy a naučí se, jak tyto metody aplikovat na svá data. Mezi detailněji probírané metody patří mnohorozměrná analýza opakovaných měření, metoda PRC (principal response curves), ko-korespondenční analýza a Procrustova analýza, ale také ordinace zahrnující informaci o prostorové proměnlivosti (db-MEM), stejně jako různé metody analýzy vztahu funkčních vlastností druhů s vlastnostmi prostředí. Závěrečné týdny (či týden, podle počtu studentů) jsou věnovány práci na malých projektech studentů, které jsou pak prezentovány v závěrečném týdnu, takže studenti předvedou svou schopnost použít alespoň jednu z vysvětlovaných metod.
Student bude schopen analyzovat mnohorozměrná data i v případě, že obsahují časové korelace mezi pozorováními (opakovaná měření) a/nebo prostorové autokorelace. Bude take schopen analyzovat vztah mezi dvěma druhy biotických společenstev pomocí ko-korespondenční analýzy a kvantifikovat a testovat vztah mezi funkčními vlastnostmi druhů a vlastnostmi prostředí.
Předpoklady
Předmět předpokládá znalosti a technické dovednosti pro užití běžných ordinačních metod (neomezené, omezené i parciální ordinace) a základní manipulace s daty. Minimum B+C studentů - 5
KBO/332
----- nebo -----
KBO/332E

Hodnoticí metody a kritéria
Rozbor jazykového projevu studenta, Seminární práce

Studenti ke konci semestru analyzují data pomocí některé z metod představených v kurzu a v poslední hodině své výsledky prezentují.
Doporučená literatura
  • P. Legendre & L. Legendre (2012): Numerical ecology. Elsevier, Amsterdam..
  • P. Šmilauer & J. Lepš (2014): Multivariate analysis of ecological data using Canoco 5..


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr