|
Vyučující
|
-
Šimek Karel, prof. RNDr. CSc.
-
Sirová Dagmara, RNDr. Ph.D.
-
Kasalický Vojtěch, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášek: Výskyt bakterií ve vodě a metody jejich stanovení, mikroskopické a kultivační metody, počty a objemy bakterií v různých typech vodních ekosystémů. Taxonomické zařazení vodních bakterií, moderní molekulární postupy, numerická taxonomie a pravděpodobnostní identifikace. Spotřeba substrátu a růst při nízkých koncentracích, kinetika spotřeby substrátu, izotopové metody stanovení aktivity a produkce vodních bakterií. Modelování růstu bakterií v kontinuální kultuře. Respirace vodních bakterií, poměr oxidace a asimilace v nízkých koncentracích, průběh biochemické spotřeby kyslíku. Vliv faktorů prostředí na růst a metabolismus vodních bakterií - teplota, kyslík a přisedání bakterií na povrch. Podíl bakterií na celkové produkci - poměr produkce řas a bakterií. Pozitivní a negativní interakce mikroorganismů ve vodním prostředí, kompetice a predace, koncept mikrobiální smyčky a mikrobiálních potravních řetězců. Biomasa bakterií v různých typech vodních ekosystémů - prostorové rozložení biomasy. Bakterie v koloběhu uhlíku - aerobní a anaerobní rozklad ve vodě a sedimentech, resistentní látky. Bakteriální procesy v koloběhu dusíku - rozklad bílkovin, nitrifikace, denitrifikace a redukce nitrátů. Bakterie v koloběhu fosforu a síry. Bakterie při čištění odpadních vod - aerobní čištění, aktivace, bakterie a prvoci. Anaerobní vyhnívání - tvorba kyselin, methanu a vodíku. Společenstva bakterií v jezerech, přehradních nádržích, tekoucích vodách a mikrobiomy. Studentům jsou poskytnuty kompletní prezentace z přednášek i s animacemi.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Práce s textem (učebnicí, knihou)
- Účast na výuce
- 30 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 10 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 40 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem přednášky je seznámit posluchače s nejnovějšími poznatky v mikrobiální ekologii vody především v následujících oblastech: role bakterií v koloběhu nutrientů, identifikace mikroorganismů z vodního prostředí moderními metodami, nejdůležitější interakce mikroorganismů v rámci tzv. mikrobiální smyčky a interakce mikrobů s dalšími trofickými hladinami.
Studenti se seznámí s nejnovějšími pokroky v oblasti vodní mikrobiální ekologie, zahrnující zejména následující oblasti: (i) roli bakterií v nutričních cyklech, (ii) moderní metody identifikace mikroorganismů z vodního prostředí (stavějící na kombinaci) moderních molekulárních přístupů s klasickými přístupy založenými na kultivaci) a (iii) hlavní toky uhlíku a energie prostřednictvím mikrobiálních potravinových pásů na vyšší trofické úrovně se spoustou reprezentativních příkladů pozitivních a negativních trofických interakcí uvnitř mikrobů ve vodních potravinových sítích.
|
|
Předpoklady
|
Studentům se doporučuje zapsat si společně s tímto předmětem také předmět KBE / 465 - "Speciální limnologie", předpokládá se také zvládnutí a obeznámení se se základními pojmy mikrobiologie.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
Zvládnutí základního učiva kurzu pro úspěšné složení zkoušky (minimálně 60% správných odpovědí).
|
|
Doporučená literatura
|
-
Straškrábová, V., Šimek, K., Vrba, J. (2005) Long-term development of reservoir ecosystems - changes in pelagic food webs and their microbial component. Limnetica, 24 (1-2): 9-20.
-
Overbeck, Jürgen,; Chróst, Ryszard J. Aquatic microbial ecology : Biochemical and molecular approaches. 1st ed. Berlin : Springer, 1990. ISBN 3-540-97222-6.
-
Pernthaler, J. Predation on prokaryotes in the water column and its ecological implications. Nature Reviews Microbiology 3(7): 537-546.. 2005.
-
Rulík, Martin. Mikrobiální ekologie vod. 1. vyd. Olomouc : Univerzita Palackého v Olomouci, 2013. ISBN 978-80-244-3477-3.
-
Straškrábová, Viera. Mikrobiální ekologie vody. 1. vyd. Praha : Ministerstvo životního prostředí ČR, 1996. ISBN 80-85368-88-9.
|