Předmět: Metody mikrobiální diagnostiky

» Seznam fakult » FPR » KME
Název předmětu Metody mikrobiální diagnostiky
Kód předmětu KME/065
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V každém akademickém roce, jen v zimním semestru.
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Mašková Hana, Mgr.
  • Eyer Luděk, doc. RNDr. Ph.D.
  • Beránková Zuzana, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Studentům budou poskytnuty podrobné informace o metodách pro diagnostiku medicínsky významných virových a bakteriálních patogenů s důrazem na vysvětlení mechanismu metod a na jejich aplikaci. Obsah přednášky: (1) Úvod do předmětu, klasifikace diagnostických metod, metody oběru a zpracování klinických vzorků, (2) Kultivační bakteriologické metody, klasické typizační postupy, biochemické metody druhové identifikace bakterií, stanovení citlivosti na antibiotika, fagotypizace (3) Kultivační virologické metody, reportérové virové systémy a animální modely, (4) Mikroskopické techniky (světelná a elektronová mikroskopie), barvicí mikrobiologické postupy, (5) Molekulárně-biologické metody v diagnostice mikroorganismů (hybridizační techniky, restrikční analýza, sekvenační metody, polymerázová řetězová reakce (PCR), kvantitativní PCR, elektroforéza nukleových kyselin, genotypizace), (6) Imunologické diagnostické metody (využití polyklonálních, monoklonálncíh a rekombinantních protilátek, aglutinační a imunoprecipitační techniky, imunoelektroforéza, imunoanalytické testy (ELISA, RIA, FIA, CLIA), dip-stick techniky a další rychlé metody pro diagnostiku mikroorganismů), (7) Metody založené na biosenzorech, elektrochemické, optické a piezoelektrické senzory, techonologie mikročipů pro diagnostiku mikroorganismů (8) Mikrobiální diagnostické metody založené na separaci a identifikaci proteinů (elektroforéza proteinů a blotovací techniky), (9) Základy hmotnostní spektrometrie, využití MALDI-TOF MS a jiných ionizačních technik pro diagnostiku.

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Demonstrace
  • Domácí příprava na výuku - 30 hodin za semestr
  • Účast na výuce - 66 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 30 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem předmětu je podat ucelený přehled mikrobiologických, biochemických, molekulárně-biologických a imunologických metod pro diagnostiku patologicky významných mikroorganismů v humánní medicíně.
Studenti rozumí principům mikrobiologických, biochemických, molekulárně-biologických a imunologických metod pro diagnostiku medicínsky významných patogenů.
Předpoklady
Viz seznam doporučených prerekvizit. Prerekvizity jsou povinné.
KBE/260 a zároveň KMB/250 a zároveň UCH/CV036
----- nebo -----
UCH/036

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška

Student musí během ústní zkoušky prokázat schopnost orientovat se v současně známých metodických přístupech pro diagnostiku mikroorganismů. Musí prokázat, že rozumí fyzikálně-chemickým mechanismům metod a současně dokáže navrhnout, kterou metodu použít v souvislosti s požadovanou diagnostikou. Zkouška je ústní s nutností zodpovědět 2 otázky ze 4
Doporučená literatura
  • JURÁNKOVÁ, Jana. Klinická mikrobiologie v laboratorní praxi. Bakalářský obor Zdravotní laborant. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2011. 73 s. ISBN 978-80-210-5657-2..
  • KNOZ, Jan a Věra OPRAVILOVÁ. Základy mikroskopické techniky. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 1992. 195 s. ISBN 80-210-0473-8.
  • PRICE, Christopher, P., a NEWMAN, David, J. (Ed.). Principles and Practices of Immunoassay. 2. vyd. London: Macmillan Reference LTD, 1997, 667 s., ISBN 1-56159-145..
  • ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005. 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1..
  • VEENSTRA, Timothy, D. a YATES John, R. (Ed.). Proteomics for Biological Discovery. New Jersey: John Wiley and Sons, Inc, 2006, 326 s, ISBN 978-0-471-16005-2..
  • VOTAVA, Miroslav, Filip RŮŽIČKA, Vladana WOZNICOVÁ, Lenka ČERNOHORSKÁ, Milada DVOŘÁČKOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ HEROLDOVÁ, Veronika HOLÁ a Ondřej ZAHRADNÍČEK. Lékařská mikrobiologie: Vyšetřovací metody. 1. vyd. Brno: Neptun, 2010. 495 s. ISBN 978-80-86850-04-7..
  • WILD, David (Ed.). The Immunoassay Handbook. 2. vyd. New York: Nature Publishing Group, 2001, 906 s., ISBN 1-56159-270-6..
  • J. B. Carter et al. Virology: Principles and Applications. 2013.
  • M. Votava et al. Lékařská mikrobiologie: Vyšetřovací metody. 1st edition. Neptun, 2010.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr