Předmět: Metody studia buňky

» Seznam fakult » FPR » KME
Název předmětu Metody studia buňky
Kód předmětu KME/614
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky V každém akademickém roce, jen v letním semestru.
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 8
Vyučovací jazyk čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky nespecifikováno
Studijní praxe nespecifikováno
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Bílý Tomáš, Mgr. Ph.D.
  • Brož Václav, Mgr. Ph.D.
  • Bruce Alexander William, prof. Ph.D.
  • Fluks Monika, Ph.D.
  • Hauserová Andrea, Mgr.
  • Matyášová Alena, Bc.
  • Žurovec Michal, prof. RNDr. CSc.
  • Sehadová Hana, Mgr. Ph.D.
  • Weyda František, doc. RNDr. CSc.
  • Rouhová Lenka, Mgr. Ph.D.
  • Collier Rebecca, MSc.
Obsah předmětu
Přednášky: 1. Histologie (zpracování tkání, fixace a barvení, parafínové řezy, totální preparáty) 2. Detekce proteinů ve tkáni a buňce (imunohistochemická technika, využití v praxi, biopsie) 3. Detekce DNA, RNA ve tkáni a buňce (in situ hybridizace, využití v praxi, FISH) 4. Světelná mikroskopie (základ + kontrastní techniky) 5. Fluorescenční a konfokální mikroskopie 6. Elektronová mikroskopie 7. Isolace DNA, RNA a proteinů 8. PCR, real-time PCR, microarrays a jejich využití v diagnostice 9. Sekvenování a základy transkriptomiky 10. Tkáňové kultury 11. Embryogeneze savců (tvorba gamet, vznik a rýhování zygoty, umělé oplodnění, vznik dvojčat) Praktická část 1. Zhotovení parafinových a polotenkých řezů 2. Histologická barvení - Mallory, hematoxylin-eosin 3. Imunohistochemická detekce specifických proteinů v tkáních hmyzu 4. Giemsa barvení krevních roztěrů, stanovení krevní skupiny pomocí klinických testů 5. Práce se světelným, fluorescenčním a konfokálním mikroskopem 6. Exkurze na pracoviště elektronové mikroskopie 7. Isolace DNA, gelová elektroforéza 8. PCR, real-time PCR, gelová elektroforéza 9. Exkurze na patologii (návštěva histologické laboratoře, biopsie) 10. Testy životaschopnosti buněk - účinnost farmak 11. Izolace oocytů z myších vaječníků a aktivace jejich meiotického dělení do stádia vhodného k oplodnění

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Pozorování, Demonstrace, Laboratorní práce, Exkurze, Práce s multimediálními zdroji (texty, internet, IT technologie), Pokus, Praktická výuka
  • Účast na výuce - 84 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 40 hodin za semestr
  • Příprava na zápočet - 40 hodin za semestr
  • Exkurze - 20 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 40 hodin za semestr
Výstupy z učení
Úkolem kurzu je prezentovat současné klasické i zcela nové metody výzkumu buněk. Důraz je kladen na dynamické aspekty základních technik používaných v optické, konfokální i konvenční elektronové mikroskopii. Speciální zájem je zaměřen na korelační mikroskopii a význam determinace artefaktů.
Studenti se seznámí na teoretické i praktické úrovni s celou škálou metod používaných především v buněčné biologii
Předpoklady
Předmět uvádí do dané problematiky, nepředpokládá specifické vstupní znalosti.

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška, Analýza výkonů studenta, Rozbor produktů pracovní činnosti studenta (technické práce), Test, Vypracování laboratorních protokolů

Požadavky na zápočet: 1) účast na praktických cvičeních (maximálně jedna absence) 2) předložení vypracovaných protokolů z jednotlivých praktických cvičení 2) úspěšné složení zápočtového testu Požadavky k ústní zkoušce: 1) složení zápočtu
Doporučená literatura
  • Celis J.E. (ed), 1994: Cell Biology. A Laboratory Handbook. Academic Press (San Diego), Vol.1-3.
  • Hunter E., 1993: Practical Electron Microscopy. Cambridge University Press (Cambridge), 173 stran.
  • Pollak J.M., Priestley J.V (eds), 1992: Electron Microscopic Imunocytochemistry. Oxford University Press (Oxford), 267 stran.
  • Williams D.B., Carter C.B. 1996: Transmission Electron Microscopy. Plenum Press (New York), Vol.I-IV.
  • Heath Julian P. Dictionary of Microscopy. 2000. ISBN 0-470-01199-8.
  • Kuo, John (Ed.). Electron Microscopy. Methods and Protocols.. 2014. ISBN 978-1-62703-776-1.
  • S. Amelinckx (Editor), Dirk van Dyck (Editor), J. van Landuyt (Editor), Gustaaf van Tendeloo (Editor). Electron Microscopy: Principles and Fundamentals.. 2008. ISBN 978-3-527-61455-4.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr