|
Vyučující
|
-
Kabeláč Martin, doc. Mgr. Ph.D.
-
Fessl Tomáš, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1.Introduction to quantum theory: Schrödinger equation and its approximations, valence bond theory, wave function. 2.Computational methods of quantum chemistry : ab initio approaches, semiempirical methodscommonly used programs in the computational chemistry. 3.Computational experiments and simulations: classical and ab initio molecular dynamics, Monte Carlo, calculations of statistical and thermodynamics values. 4.Intra- and intermolecular interactions in biomolecules. 5. Empirical force fields, molecular dynamics, homology modeling 6. Biopolymers -Nucleic acids and Proteins: structure and dynamics dominant effects during the process of protein folding, geometrical parameters of polypeptide chain, peptides, docking, combinatorial chemistry, QSAR methods. 7.Structural databases in chemistry and biology: Retrieving of structures, statistical methods, data sorting and handling.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
- Domácí příprava na výuku
- 30 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 30 hodin za semestr
- Účast na výuce
- 50 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
To obtain a basic knowledge about methods used in theoretical chemistry, how to calculate the structures and properties of molecules with the stress on biopolymers.
basic orientation in quantum mechanics, theory of quantum chemical calcualtions and molecular modelling
|
|
Předpoklady
|
žádné zvláštní předpoklady
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
Úspěšné zodpovězení alespoň 50% otázek na zkoušce.
|
|
Doporučená literatura
|
-
LEACH A., Molecular Modelling: Principles and Applications, Pearson Education EMA, January 2001.
-
YOUNG D., Computational Chemistry, A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems , John Wiley and Sons Ltd., England 2001.
|