Předmět: Optical Methods in Biochemistry

» Seznam fakult » FPR » UCH
Název předmětu Optical Methods in Biochemistry
Kód předmětu UCH/651
Organizační forma výuky Přednáška + Seminář
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Četnost výuky In each academic year, in the summer semester.
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Dostupnost předmětu Předmět je nabízen přijíždějícím studentům
Vyučující
  • Kopecký Vladimír, RNDr. Ph.D.
  • Bína David, RNDr. Ph.D.
  • Litvín Radek, RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Obsah přednášky: 1. Teoretický úvod: záření, interakce světla a hmoty, absorpce, emise, rozptyl 2. Praktické aspekty: zdroje záření, detekční metody, principy, použití 3. Metody založené na rozptylu světla makromolekulami, DLS; absorpční spektroskopie 1 4. Absorpční spektroskopie 2: časově rozlišené metody 5. Lineární a cirkulární dichroismus 6. Fluorescence 1, základy metody: excitační emisní spektra, fluorofory, FRET 7. Fluorescence 2, časově rozlišená fluorescence, fluorescenční korelační spektroskopie 8. Optická mikroskopie: konfokální, lokalizace, vysoké rozlišení 9. Vibrační metody, úvod 10. FTIR 11. Metody Ramanovské spektroskopie, resonanční Ramanovská spektroskopie 12. Teoretické cvičení pro shrnutí učiva semestru, řešení vybraných problémů metodami optické spektroskopie Obsah cvičení: V průběhu cvičení budou prohloubeny znalosti získané v průběhu přednášek, metody budou předvedeny v praxi.

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Exkurze, Praktická výuka
  • Účast na výuce - 39 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 40 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 40 hodin za semestr
Výstupy z učení
Přednášky přiblíží studentům teoretické a praktické informace z oblasti použití optických metod v biochemii.
Studenti získají pochopení principů absorbce a emise světla včetně polarizačních efektů. Studenti se naučí principy, výhody a nevýhody a důležité experimentální aspekty probíraných metod optické spektroskopie a zobrazování. Velká část probíraných metod je demonstrována na relevantních vzorcích.
Předpoklady
Studenti by měli mít základní znalosti o světle jako elektromagnetickém záření a jeho vlastnostech, alespoň na úrovni gymnaziální fyziky.

Hodnoticí metody a kritéria
Kombinovaná zkouška

Úspěšné zodpovězení alespoň 50% otázek na zkoušce.
Doporučená literatura
  • Lakowicz J.R.: Principles of fluorescence spectroscopy, 3rd edition, Springer, 2006.
  • Prosser V., ed.: Experimentální metody biofyziky, Academia, 1989.
  • Selvin P.R., Ha T.: Single-molecule techniques, CSH Press, New York, 2008.
  • van Holde K.E., Johnson W.C., Ho P.S.: Principles of Physical Biochemistry, 2nd edition, Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, 2005.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr