|
Vyučující
|
-
Dyčka Filip, Mgr. Ph.D.
-
Franta Zdeněk, RNDr. Ph.D.
-
Hořejší Karel, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášek: 1. týden: Úvod do omických věd a systémové biologie, genomika (2h) 2. týden: Genomika (2h) 3. týden: Transkriptomika (2h) 4. až 6. týden: Proteomika (6h) 7. až 8. týden: Lipidomika (4h) 9. týden: Metabolomika (2h) 10. týden: Rezerva
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
- Účast na výuce
- 20 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 30 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 50 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Předmět si klade za cíl poskytnout studentům komplexní přehled o systémové biologii s využitím omických přístupů za účelem porozumění a rozvíjení našeho chápání různých (pato)fyziologických procesů a mechanizmů probíhajících v živých organismech. Důraz je rovněž kladen na moderní analytické techniky a postupy používané v klinickém a biomedicínském výzkumu ke screeningu a monitorování biologických systémů a k odhalení dosud neznámých molekulárních hráčů v mnoha nemocech včetně rakoviny.
Students know the various techniques used in omics (k1), can explain the principles of various techniques (k2), compare, differentiate and evaluate the differences in various methods (k4, k5), and design a protocol for sample analysis for a specific application (k6).
|
|
Předpoklady
|
Prerekvizity: KMB/758 (Molecular Biology and Genetics I) KMB/605 (Introduction to Bioinformatics) UCH/757 (Biochemistry 1) UCH/643 (Biochemistry 2)
KMB/758 a zároveň KMB/605 a zároveň UCH/757 a zároveň UCH/643
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
Požadavky: Pro úspěšné absolvování předmětu je nutné získat z písemné zkoušky alespoň 50 % bodů.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Ekroos, K., ed. . Lipidomics: Technologies and Applications, 1st Edition. Weinheim, Germany: Wiley-VCH Verlag (2012).. ISBN 978-3-527-33098-0.
-
Han, X. Lipidomics: Comprehensive Mass Spectrometry of Lipids, 1st Edition. Hoboken, New Jersey: John Wiley & Sons (2016)..
-
Holčapek, M. and Ekroos, K., eds. Mass Spectrometry for Lipidomics: Methods and Applications, 1st Edition. Weinheim, Germany: Wiley-VCH Verlag (2023).. ISBN ISBN 978-3-527-33.
-
Rehm. . Protein Biochemistry and Proteomics, 1st Edition. Elsevier Science Publishing Co Inc (2006).. ISBN 9780120885459.
-
Twyman, R. Principles of Proteomics, 1st Edition. London: Taylor & Francis Ltd (2004). ISBN 9781859962732.
-
Wu, C. H, Arighi, C. N., and ross, K. E., eds. . Protein Bioinformatics: From Protein Modification and Networks to Proteomics, 1st Edition. New York: Humana Press (2017)..
|